弘化4年（1847年）、第9代藩主・三浦弘次の長男[2]として生まれる。
父が病弱だったため、第一次長州征伐・第二次長州征伐に出陣している[2]。父は佐幕派だったが、顕次は勤皇派であり、慶応3年（1867年）からは津山藩（松平慶倫）・備中松山藩（板倉勝静）との佐幕同盟を脱している[2]。慶応4年（1868年）5月6日、父の隠居を受けて正式に家督を継いだ[1]。明治2年（1869年）の版籍奉還で知藩事となる。また、藩名を真島藩に改めた[3]。明治4年（1871年）の廃藩置県で免官された。
明治17年（1884年）、華族令施行に伴い子爵に叙せられる。明治28年（1895年）9月11日、49歳で死去した。
