天正6年（1578年）、羽柴秀吉の家臣だった古田重則の三男として生まれる。父の死後、家督は長兄の重勝が継いでいたが、重勝が慶長11年（1606年）に死去した際、重勝の子である希少丸（後の重恒）が4歳と幼かったことから、重治が跡を継ぐこととなった。元和5年（1619年）2月13日に伊勢松坂から石見浜田へ移封された。元和6年（1620年）2月から3年かけて浜田城とその城下町を完成させた。また、浜田川、浅井川の治水工事に務めている。元和9年（1623年）5月、家督を重恒に譲って江戸で隠居した。寛永2年（1625年）11月25日（異説として11月9日）、江戸で死去した。享年48。