寛永2年（1625年）8月、初代藩主・立花種次の長男として生まれる。寛永7年（1630年）、父の死去により家督を継ぐ。寛永14年（1637年）の島原の乱では幼少のため、叔父の立花忠茂が代理として出陣している。
成長してからは藩政を取り仕切り、島原の乱後から行なわれた踏絵、宗門改めを強化した。さらに三代官制を五代官制に改めて農民統制を強化した（承応元年（1652年）に三代官制に再編）。その一方で家臣・平塚信昌を重用して早鐘地を築き、通水用の早鐘眼鏡橋（国の重要文化財）を架橋するなど、藩政の確立に尽力した。万治3年（1660年）、12月28日に従五位下、和泉守に叙任する。
天和2年（1682年）2月27日、長男・種明に家督を譲って隠居し、道運と号した。宝永8年（1711年）2月1日に三池で死去した。享年87。