戦国時代の元亀・天正年間に薬師如来のお告げで発見。上杉謙信が蓮華温泉付近で開発したと伝えられる鉱山[1]。鉛や亜鉛のほか少量の銀が採れたため蓮華銀山、雪倉銀山とも呼ばれた[2]。
江戸時代になると、高田藩や各地の山師が開発に着手するも失敗に終わった。大和国の金山師、万蔵が大所村の村人を使役して開発した際には、資金に行き詰まり村人に賃金を払わず夜逃げしたこと。さらに撤退後に不作の年が続き、山の祟りと恐れられたことなど、地域にとっては厄介な存在にもなった。1800年（寛政12年）、藩から銀山開発への諮問を受けた大所村の庄屋らは「深山幽谷にあるため、次々と開発に着手しても長続きしない。」との回答を行っている[3]。
天保年間に現上越市の高橋孫左エ門が再開発に着手するも、山間僻地でかつ10月下旬に降雪が観られる過酷な気象条件下で長くは続かった。
明治時代末期から大正時代にかけて、蓮華鉱山合資会社が組織的な採掘を行っていた記録が残るが、事業的に成功していたとは考え難い。
蓮華鉱山合資会社が撤退後、1930年（昭和5年）に中島商事が開発を計画、1935年（昭和10年）に中島知久平が試掘を行っているが操業には至らなかった。第二次世界大戦後、1951年（昭和26年）に三菱金属鉱業が開発を計画したが、こちらも頓挫した[4]。
2003年、大正期の蓮華鉱山事務所の写真が発見され、新潟日報などに掲載された。写真からは、極めて小規模な事業所であることが窺える。
蓮華温泉から朝日岳に至る登山道の「鉱山道」として名が残っており[5]、蓮華温泉から1時間ほど登った道の周辺には製錬所跡やズリ山が散見できる。
