- 近代哲学原理の崩壊と再建 文雅堂書店 1957
- 現代哲学の系譜 十九世紀後半の欧州哲学思想史 創文社 1961
- シェリング 勁草書房 1962 (思想学説全書)
- 若き人々に 理想社 1964 (人生論ブックス)
- 歴史的世界と人間存在 生命・精神・実存の哲学体系序説 理想社 1964
- 人間形成と実存哲学 明治図書出版 1967
- 愛に生きる心得 迷うとき何を希求し何を学ぶべきか 大和書房「銀河選書」 1969
- 哲学的人間学 紀伊国屋新書 1970
- ニーチェ その思想と実存の解明 中央公論社「中公新書」 1970
- 現代哲学入門 人と思想と言葉 大和出版販売 1974 (グリーン・ブックス)
- 哲学的人間学 古くて新しい人間への問い 旺文社 1979.7 (テレビ大学講座)
- 体系と展相 哲学的人間学 二玄社 1981.9
- 人生余情 藤田健治喜寿記念随筆集 二玄社 1981.9
- 哲学的人間学 人間の本質把握への新しい試み 放送大学 1985.3
- 哲学的人間学方法論・生の連続と非連続のパースペクティヴ 刀水書房「人間科学叢書」1988.1
- 光と影ろい 日本精神史における理念の形態 紀伊国屋書店 1989.4
- 漱石 その軌跡と系譜 鴎外・龍之介・有三 文学の哲学的考察 紀伊国屋書店 1991.6
- 西田幾多郎 その軌跡と系譜 桑木厳翼・田辺元・高坂正顕・山内得立 哲学の文学的考察 法政大学出版局 1993.3、新版1997
- カント解釈の基本問題 その人間学的還元 法政大学出版局 1994.1
- 藤田健治著作集 新樹社（全7巻） 1995-97
（古田光、
藤田健治、
木田献一、
屋形禎亮、
澤柳大五郎、
廣川洋一、
中野幸次、
秀村欣二、
兼岩正夫、
清水富雄、
裾分一弘、
下村寅太郎、
西沢龍生、
永井博
による共編著）
- 歴史の理論 阿部玄治共著 旺文社 1983.8 (ラジオ大学講座) のち放送大学教材
（澤柳大五郎、
関根正雄、
村治能就、
浅野順一、
中野幸次、
秀村欣二、
兼岩正夫、
清水富雄、
渡辺金一、
下村寅太郎、
西沢龍生、
藤田健治、
永井博
による共編著）
.svg){kind=small}
