C2ドメイン
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C2ドメイン(英: C2 domain)は、タンパク質の細胞膜への標的化に関与するタンパク質ドメインである。典型的なタイプ(PKC-C2)は8つのβストランドから構成されるβサンドイッチ構造をしており、2つまたは3つのカルシウムイオンを配位する。カルシウムイオンは膜結合側に位置する、ドメインの最初と最後のループによって形成されるくぼみに結合する。一方、他のC2ドメインファミリーの多くはカルシウムイオン結合活性を持っていない[2][3]。
| Phosphoinositide 3-kinase C2 | |||||||||||
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PI3キナーゼの構造[1] | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| 略号 | PI3K_C2 | ||||||||||
| Pfam | PF00792 | ||||||||||
| InterPro | IPR002420 | ||||||||||
| SMART | PI3K_C2 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC50004 | ||||||||||
| SCOP | 1e8x | ||||||||||
| SUPERFAMILY | 1e8x | ||||||||||
| CDD | cd08380 | ||||||||||
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他のドメインとの共役
C2ドメインはしばしば酵素活性を有するドメインと共役しているのが見つかる。例えば、PTENのC2ドメインはホスファターゼドメインを細胞膜に接触させ、そこで基質であるホスファチジルイノシトール-3,4,5-トリスリン酸(PIP3)の脱リン酸化を行う。これによって、膜からPIP3を取り出すというエネルギー的に非常にコストの高い過程が不要になる。PTENはプロテインチロシンホスファターゼドメインとC2ドメインという2つのドメインから構成される。このドメインのペアはスーパードメインを構成し、遺伝的ユニットとして菌類、植物、動物のさまざまなタンパク質に見つかる[4]。加えて、ホスホイノシチドのイノシトール環の3-ヒドロキシル基をリン酸化する酵素PI3キナーゼもまた、膜に結合するためにC2ドメインを利用する(1e8w)。
進化
カルシウムと脂質の選択性
C2ドメインは、細胞膜の主要な構成要素であるホスファチジルセリンとホスファチジルコリンを含む、広い脂質選択性を示すという点で、膜標的化ドメインの中で独特である。プロテインキナーゼCのC2ドメインは約116アミノ酸残基からなり、2コピーのC1ドメイン(ホルボールエステルとジアシルグリセロールに結合、PDOC00379を参照)とプロテインキナーゼ触媒ドメイン(PDOC00100を参照)の間に位置する。C2ドメインと相同性を示す領域は多くのタンパク質に見つかる[6]。C2ドメインはカルシウム依存的なリン脂質結合と[7]、細胞内局在化などの膜標的化過程に関与していると考えられている。C2ドメインの大部分は膜(リン脂質)に対しCa2+依存的に相互作用するが、一部はCa2+への結合がなくても膜と相互作用することができる。同様に、C2ドメインは異なる脂質特異性を有するように進化している。シナプトタグミンのC2Aドメインなど、多くのC2ドメインは陰イオンリン脂質(ホスファチジルセリンやPIP2を含むリン脂質)に結合する。一方、他のcPLA2αののC2ドメインなど、他のC2ドメインは双性イオン脂質(ホスファチジルコリンなど)に結合する。このCa2+と脂質結合の多様性と選択性は、C2ドメインがさまざまな機能へ進化していることを示唆している[8]。