アスティカカウリス属

アスティカカウリス属の英名については、古代ギリシア語における否定の接頭辞”a”、新ラテン語で棒を意味する名詞”sticca”、ラテン語で茎を意味する男性名詞”caulis”で構成されており、全て合わせて「棒ではない茎」を意味するラテン語男性名詞となる^[3]。これは、同じカウロバクター科であり、細胞分裂の際に特徴的な棒状の細胞"stalked cell"を形成するカウロバクター属と関連付けられた時、アスティカカウリス属細菌は細胞分裂でstalked cellを形成しないことに因む^[17]。

桿状無色の単細胞のプロステーカ細菌である^[1]。プロステーカは細胞極ではない部位から生じ、接着物質は伴わない。増殖は、プロステーカを持つ細胞の分裂によって発生し、分裂後は、プロステーカを継承した有柄細胞（stalked cell）と、それよりも小さく、細胞極の中心に単一の鞭毛を持ち運動性を示すがプロステーカは持たない遊泳細胞（nonstalked cell）が生まれる。遊泳細胞は成長すると、プロステーカを発生させて運動性を示さなくなる栄養期に入る。接着物質は、茎の発生部位とは異なる細胞極又はその付近の部位から、遊泳期と栄養期の両方において分泌される。この接着物質により、細胞は環境中の物体表面に接着したり、他の細胞と結合してロゼットを形成したりできる。

以下の種を含む（2024年9月現在）^[3]。

本属のタイプ種である。 "excentricus"は、ラテン語で「（物体）の内部から」を意味する前置詞"ex"と、「（円の）中心点」を意味する中性名詞"centrum"と、「～に関係する」を意味する"-icus"を組み合わせた造語であり、「中心から外へ」を意味する。DNAのGC含量は59.5%であり、ゲノムサイズは4.31Mbpである^[18]。タイプ株はATCC 15261^T(=CIP 107064^T、=DSM 4724^T、=VKM B-1370^T)である^[18]。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はAB016610である。

タイプ株はATCC 27554^T(=CIP 107000^T、=DSM 4723^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はAJ247193である^[19]。

"taihuensis"は、新ラテン語で「太湖に関連する」を意味する女性形容詞であり、この細菌が太湖の湖底堆積物から発見されたことに由来する。グラム陰性、好気性、非胞子形成性の桿菌である^[13]。単一の極鞭毛で運動する。細胞極の近くで単一の典型的なプロステーカを形成し、それには接着剤は存在しない。DNAのGC含量は59mol%である。タイプ株はT3-B7^T(=AS 1.3431^T、=JCM 12463^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はAY500141である。

"benevestitus"は、ラテン語で「よく」を意味する副詞"bene"と、「包まれた」を意味する形容詞"vestitus"を組み合わせた造語であり、「よく包まれた」を意味する。グラム陰性の桿菌（幅0.5～0.7×長さ1.4～2.0μm）である^[6]。二分裂で増殖する。二形性の生活環において、細胞亜極にプロステーカを持つ固着細胞が分裂して、細胞極に単一の鞭毛を持つ運動細胞が生じる。この運動細胞はやがて直径0.10～0.15μmの単一の非接着性プロステーカを細胞亜極から生じさせる。10℃未満の温度では、ほとんどのプロステーカ細胞は円錐形のベル型の鞘に包まれており、この鞘はプロステーカと細胞の接合点で細胞と連結している。PYG培地で20℃で7日間インキュベートしたコロニーは不透明白色、平滑、直径1～2.5mmの円形で、縁全体が凸状でである。好気性の化学有機栄養生物であり、炭素源としてグルコース、スクロース、キシロース、マルトース、ガラクトース、アラビノース、ラクトース、フルクトース、エタノール、酢酸、リンゴ酸、フマル酸、コハク酸、ラフィノース、ラムノース、及びトレハロースを利用できる。培養には酵母エキスが必要である。生育条件は温度4～28℃（最適15～20℃）且つpH 4.5～8.3（最適pH 5.6～6.0）である。NaClは生育に必要ではなく、2.0%(w/v)濃度までの耐性がある。原核生物のタンパク質合成を阻害する抗生物質に感受性を示す。主要な脂肪酸は18:1ω7cであり、主要なリン脂質はホスファチジルグリセロールである。DNAのGC含量は58.4mol%で、ゲノムサイズは4.99Mbpである^[18]。タイプ株はZ-0023^T(=DSM 16100^T、=ATCC BAA-896^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はAM087199である。

"solisilvae"は、ラテン語で「土」を意味する名詞"solum"と、「森林」を意味する名詞"silva"を組み合わせた造語であり、「森林土壌の／に由来する」を意味する。単一の鞭毛を持ち運動性を有する、グラム陰性且つ偏性好気性の桿菌 (幅0.30～0.75μm、長さ1.3～ 2.4μm)である^[11]。コロニーは象牙色でクリーミーな質感の円形である。生育条件は温度10～37℃（最適25～30℃）且つpH 4.5～9.5（最適5.0～7.0）である。DNAのGC含量は63.7mol%である。タイプ株はCGM1-3EN^T(= AIM0088^T、= KCTC 32102^T、= JCM 18544^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はJX144961である。

"endophyticus"は、ギリシャ語で「内部へ」を意味する前置詞"endo"、「植物」を意味する名詞"phyton"を組み合わせた造語であり、「植物内部に存在する」を意味する男性形容詞となる。この命名は、この細菌が植物組織から単離されたことに由来する。R2A寒天培地で2日間インキュベートしたコロニーは薄黄色の平滑な円形凸状であり、直径1～2mmであり、縁は規則的である^[9]。R2A寒天培地、NA寒天培地及びTSA寒天培地では良好に培養できる。マッコンキー寒天培地又は麦芽エキス寒天培地では培養できない。カタラーゼ及びオキシダーゼ陽性である。DNAのGC含量は57.8mol%である。タイプ株はZFGT-14^T(= CCTCC AB 2013012^T、= KCTC 32296^T、= LMG 27605^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はKF551184である。

"tiandongensis"は、新ラテン語で「Tiandongに関連する」を意味する男性形容詞である。グラム陰性、好気性、カタラーゼ陽性、オキシダーゼ陽性、運動性で、単一の極鞭毛を持つ桿菌（幅0.3～0.5µm、長さ0.7～1.2µm）である^[15]。プロステーカは形成しない。コロニーは黄色がかった滑らかな円形且つ凸状であり、直径は1.0～4.0mmである。生育条件は温度10～40℃且つpH 5.0～8.0であり、最適条件は30℃且つpH 7.0である。最大1%(w/v)のNaCl濃度に耐えることがRA2培地での培養で確認されている。DNAのGC含量は56.0mol%である。タイプ株は3.1105^T(=KCTC 62978^T、=CCTCC AB 2018268^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列及びゲノム配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はそれぞれMH605318及びSSBC00000000である。

• Asticcacaulis aquaticus

aquaticusはラテン語で「水生の」を意味する男性形容詞であり、この菌株が最初に発見された場所に由来する。タイプ株はBYS171W^T(=GDMCC 1.3226^T、=KCTC 92612^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はOQ130452である。

• Asticcacaulis currens

currensはラテン語で「動く」を意味する男性形容詞である。タイプ株はDXS10W^T(=GDMCC 1.3224^T、=KCTC 92543^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はOQ130453である。

• Asticcacaulis machinosus

machinosusはラテン語で「巧みに構築された」を意味する男性形容詞である。タイプ株はLKC15W^T(=GDMCC 1.3225^T、=KCTC 92544^T)である。この株の16S rRNA遺伝子配列のGenBank/EMBL/DDBJアクセッション番号はOQ130454である。

これら3種の主要な細胞脂肪酸は、summed feature 3（C_16:1 ω7c及び/又はC_16:1 ω6c）、summed feature 8（C_18:1 ω7c及び/又はC_18:1 ω6c）、C_16:0並びに11-メチルC_18:1 ω7cである^[4]。それらの極性脂質は主にホスファチジルグリセロール、糖脂質及び窒素含有リン酸化糖脂質で構成されている。