Miller, Furnish, and Schindewolf (1957)はクリメニア目にGonioclymeniaceae、Clymeniaceae、Parawocklumeriaceaeの3上科を含めた[4]。Gonoclymeniaceaeは5科、Clymeniaceaeは3科、ParawocklumeraceaeはParawocklumeriidaeの1科のみを含む[4]。
Saunders, Work, and Nikolaeva (1999)はクリメニア目をGonioclymeniinaとClymeniinaの2つの亜目に分割した[5]。Gonioclymeniinaは7科20属のSellaclymeniaceaeと1科6属のGonioclyemniaceae、そして1科3属のParawocklumeraceaeを含む[5]。ClymeniinaはClymeniaceaeのみを含み、下位分類として合計5科36属を包含する[5]。
GONIATのwebサイトによれば、クリメニア目には4上科を含むClymeniinaと1上科からなるGonioclymeniinaの2亜目が分類される[6]。それとは対照的に、Korn (2006)はクリメニア目をClymeniinaとCyrtoclymeniinaに二分した[7]。一方で、Shevyrev (2006) はクリメニア目をClymeniinaとGonioclymeniinaに二分し、GONIATやSaunders, Work, and Nikolaeva (1999)と共通する見解を示している[8]。