DNMT3B

SymboleDNMT3B

SynonymesDNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta

Caractéristiques générales
DNMT3B

Symbole	DNMT3B
Synonymes	DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta
Locus	20q11.21

L'ADN (cytosine-5-)-méthyltransférase 3 bêta est une enzyme qui, chez l'homme, est codée par le gène DNMT3B^[1]. Les mutations dans ce gène sont associées à une immunodéficience et à une instabilité centromérique et syndrome d'anomalies faciales^[2].

La méthylation CpG est une modification épigénétique importante pour le développement embryonnaire , l’empreintage parental et l’inactivation du chromosome X. Des études chez la souris ont démontré que la méthylation de l'ADN est nécessaire au développement des mammifères. Ce gène encode une ADN méthyltransférase dont on pense qu'il fonctionne dans la méthylation de novo, plutôt que dans la maintenance de la méthylation. La protéine est principalement localisée dans le noyau et son expression est régulée au cours du développement. Huit variants d'épissage alternatifs de transcrits ont été décrits. Les séquences complètes des variantes 4 et 5 n'ont pas encore été déterminées^[1].

DNMT3B est requise pour la méthylation de novo à l'échelle du génome et est essentielle pour l'établissement de schémas de méthylation de l'ADN au cours du développement. La méthylation de l'ADN est coordonnée avec la méthylation des histones. DNMT3B peut préférentiellement méthyler l'ADN nucléosomal dans la région centrale du nucléosome^[3]. Elle peut également fonctionner comme co-répresseur de transcription en s'associant à CBX4 et indépendamment de la méthylation de l'ADN. Elle semble être impliquée dans le processus de silençage des gènes. En association avec DNMT1 et via le recrutement de CTCFL / BORIS, DNMT3 est impliquée dans l'activation de l'expression du gène BAG1 en modulant la diméthylation H3 aux résidus K4 et K9 des histones à son promoteur^[4]. DNMT3B fonctionne également comme co-répresseur transcriptionnel en s'associant à ZHX1. Enfin, elle est requise pour la désactivation de DUX4 dans les cellules somatiques^[5].

Isoformes

DNMT3B possède 8 isoformes^[3]. Les isoformes 4 et 5 ne sont probablement pas fonctionnels en raison de la suppression de deux motifs méthyltransférase conservés^[6].

Importance clinique

Le syndrome d'immunodéficience-instabilités centromériques-anomalies faciales (ICF) résulte de défauts dans la maturation des lymphocytes résultant d'une méthylation aberrante de l'ADN provoquée par des mutations du gène DNMT3B^[2].

Les variants du gène peuvent également contribuer à la dépendance à la nicotine^[7].

Interactions

Il a été démontré que DNMT3B interagit avec:

Références

1 2 « Entrez Gene: DNMT3B DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta »
1 2 « The ICF syndrome, a DNA methyltransferase 3B deficiency and immunodeficiency disease », Clinical Immunology, vol. 109, n^o 1,‎ octobre 2003, p. 17–28 (PMID 14585272, DOI 10.1016/S1521-6616(03)00201-8)
1 2 « DNMT3B », sur www.genecards.org (consulté le 14 mars 2019)
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↑ « DNMT3B - DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B - Homo sapiens (Human) - DNMT3B gene & protein », sur www.uniprot.org (consulté le 14 mars 2019)
↑ « Genome-wide association study across European and African American ancestries identifies a SNP in DNMT3B contributing to nicotine dependence », Molecular Psychiatry,‎ octobre 2017 (PMID 28972577, DOI 10.1038/mp.2017.193)
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Bibliographie complémentaire

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v · m Chromosome 20 humain
Gènes	GNAS CHRNA4 ADA DNMT3B COL9A3 COL20A1
Maladies liées	Trisomie 20 Maladie de Hirschsprung Dysplasie fibreuse des os Syndrome de McCune–Albright Épilepsie frontale à crises nocturnes Déficit immunitaire combiné sévère par déficit en adénosine-désaminase ICF syndrome Syndrome d'Alagille Syndrome de Bardet-Biedl Syndrome de McKusick Kaufman Neurodégénerescence associée à la pantothénate-kinase Galactosialidose