Daniel Toft Jakobsen comme en 1999 des études en sciences politiques à l'université d'Aarhus. Il s'engage en parallèle au sein de la Social-démocratie, dont il préside la section locale d'Aarhus de 2002 à 2005. Il obtient son diplôme la même année, et commence ensuite à travailler pour Kristeligt Forbund for Studerende(en), une association danoise d'étudiants luthériens. En 2011, il est recruté comme consultant spécial pour la faculté de médecine de l'université d'Aarhus[1].
Lors des élections locales de , il est élu conseiller municipal de Hedensted[3]. De nouveau candidat aux élections législatives de , il est cete fois-ci élu député de plein exercice[4]. Conformément aux règles internes des sociaux-démocrates sur le cumul des mandats, il quitte alors son mandat de conseiller municipal[5].
En , il rompt avec la ligne de son parti en votant contre un projet de loi controversé porté par la ministre de l'Immigration et de l'Intégration Inger Støjberg durcissant les conditions du droit d'asile. Il estime que certaines dispositions du texte, qui prévoit notamment l'allongement du délai de regroupement familial ou la confiscation de bijoux appartenant aux demandeurs d'asile, pourrait contrevenir aux dispositions de la Convention européenne des droits de l'Homme. Au sein des sociaux-démocrates, seuls lui, Mette Gjerskov et Yildiz Akdogan s'opposent au texte[6],[7].
En , il déclare s'inquiéter pour la liberté de religion au Danemark, s'opposant à plusieurs propositions formulées dans le débat public comme l'interdiction des salles de prière ou la réduction du soutien public aux écoles musulmanes[8]. En , il perd son poste de porte-parole du groupe parlementaire social-démocrate pour les questions liées aux écoles privées au profit de Lars Aslan Rasmussen, alors que la question du soutien public aux écoles privées musulmanes est au cœur de négociations parlementaires autour d'un nouveau projet de loi[9].
Il est réélu pour un deuxième mandat de député lors des élections législatives de [10]. Alors que son parti fait son retour au gouvernement après le scrutin, Daniel Toft Jakobsen devient le porte-parole du groupe parlementaire social-démocrate sur les questions de handicap et de développement international[11].
En , il publie un livre dans lequel il réaffirme ses craintes pour la liberté d'expression et de religion au Danemark, et critique la ligne politique en matière d'immigration de la Première ministre et présidente des sociaux-démocrates, Mette Frederiksen[12].
Candidat à un troisième mandat lors des élections législatives du , il échoue à être réélu, devenant seulement le premier suppléant social-démocrate dans sa circonscription[13].
En , il devient le secrétaire générale de Mission Afrika, une organisation missionnaire protestante danoise engagée sur en Afrique occidentale et au Moyen-Orient[14].