Ordonné diacre le et prêtre le au titre des Missions étrangères, il part pour le Cambodge le .
Il étudie le viêtnamien à Xom-Bien. En 1884, il est chargé de la chrétienté de Prek-Treng sur le Bassac à 30 km au Sud de Phnom-Penh. Le , Prek-Treng est attaquée par des insurgés; les chrétiens se replient alors sur la capitale. Le Père Bouchut est alors envoyé au Sanatorium de Béthanie à Hong Kong pour être soigné, puis renvoyé en France en 1888, en raison de son état de santé. Une fois rétablie, il devient professeur puis supérieur du Séminaire des Missions étrangères à Bièvres[1].
Le il est nommé Vicaire apostolique du Cambodge.
En 1919, il fonde le carmel Notre-Dame de l’Espérance, sur la presqu'île de Chroy Changvar(it), à une rive du Mékong du centre. Les bâtiments du couvent, confisqués sous la dictature des Khmers rouges, puis transformés en orphelinat, sont détruits en . Le Carmel s'est alors transféré à Ang Snuol, à une quarantaine de kilomètres de la capitale, où il accueille aujourd’hui sept sœurs coréennes[2].
Le , le Saint-Siège change le nom de cette circonscription ecclésiastique en «Vicariat apostolique de Phnom-Penh».
Il meurt le à Giêng, après avoir fait sacré son évêque coadjuteur, Monseigneur Valentin Herrgott.
