La construction d'une gare sur la voie ferrée entre Tunis et Grombalia est à l'origine de la création de ce hameau organisé en paroisse de 1892 à 1897. C'est sans doute à cette époque qu'un premier lieu de culte est bâti sur un terrain d'une superficie de dix ares acheté au prix d'un franc par la société La Tunisienne[1]. Deux curés se succèdent, les abbés Bonhomme et Reyboubet, avant que Khanguet Gare ne perde son titre de paroisse pour être rattaché à Grombalia en 1897. En 1922, on y compte 300 fidèles[2].
En 1929, l'édifice est remplacé par l'église actuelle et béni par l'archevêque de Carthage, Monseigneur Alexis Lemaître[1]. De style néo-roman, elle est constituée d'une nef unique sans transept comme la plupart des églises tunisiennes[3]. En 1938, on y adjoint un clocher considéré par le journal La Tunisie catholique comme « un des plus réussis de l'intérieur tunisien ; il fait bonheur à l'architecte, à l'entrepreneur et aussi aux souscripteurs »[1]. Placé latéralement par rapport à la façade principale, celui-ci est coiffé d'une flèche de forme conique, ce qui est assez rare en Tunisie[4].