アカントメリディオンはArtiopoda類（三葉虫・光楯類などを含む大グループ）の節足動物である。その中で、アカントメリディオンはかつてシャンダレラ類（Xanderallida、シャンダレラやシンダレラなどを含んだ群）として分類された[2]。しかし、新たな特徴に基づいた Hou et al., 2016 の分岐学的見解では、アカントメリディオンは他のArtiopoda類より早期に分岐したとされる[2]。
アカントメリディオン属（Acanthomeridion）は Bergstrom & Hou 1997 によって単型科であるアカントメリディオン科（Acanthomeridiidae）に含められた[4]が、Hou et al., 2016 に科不明とされるようになった[2]。1989年に記載され、2008年まででは8つの化石標本のみが知られる[3] Acanthomeridion serratum と、2016年に記載され、3つの化石標本によって知られる Acanthomeridion anacanthus という2種が認められる[2]。
- Acanthomeridion serratum Hou, Chen & Lu, 1989
- 胴部11節、後方数節は左右に長い棘をもつ[2]。
- Acanthomeridion anacanthus Hou et al., 2016
- 胴部12節、後方数節の左右は長い棘を欠く[2]。
