ジュバ空港

航空会社	就航地
バドル航空	ワウ空港（ワーウ）、 ハルツーム国際空港（ハルツーム）
ターコ・エア（英語版）	ハルツーム国際空港（ハルツーム)
エチオピア航空	ボレ国際空港（アディスアベバ）、エンテベ国際空港（エンテベ）
ケニア航空	ジョモ・ケニヤッタ国際空港（ナイロビ）
フライ540	ジョモ・ケニヤッタ国際空港 （ナイロビ ）
ルワンダ航空	エンテベ国際空港（エンテベ）、キガリ国際空港（キガリ）
エジプト航空	カイロ国際空港（カイロ）
フライドバイ	ドバイ国際空港（ドバイ）
ターキッシュエアラインズ	イスタンブール新空港（イスタンブール）
国連人道支援航空サービス

貨物航空会社

航空会社	就航地
アストラル・アビエーション	ジョモ・ケニヤッタ国際空港（ナイロビ）
ナスエア	マッサワ国際空港（マッサワ）

• 2013年12月14日、クーデター未遂事件が発生。混乱を避けるため同日から18日まで空港が閉鎖された^[1]。
• 2015年11月4日、2015年ジュバ空港墜落事故が発生。An-12型機が離陸直後に滑走路から800メートルの地点に墜落。乗員乗客39名のうち37名が死亡し、生存者は乗客2名（うち1名は生後13ヶ月の女児）だった。
• 2021年11月2日、地元企業が運航するAn-26型機が離陸直後に墜落。乗員5名が死亡した。