ハプログループN9 (mtDNA)
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ハプログループN9 (mtDNA)は分子人類学におけるミトコンドリアDNAハプログループの一タイプであり、ハプログループN (mtDNA)の子型である。
ハプログループN9はN9a、N9b、Yの3つの下位系統に分かれる。3つの下位系統の最も近い共通祖先は非常に古く、Behar et al. (2012)によれば今より45709.7 (SD 7931.5)年前[1]、FTDNAによれば今より45,114 (99% CI 51,689 - 39,061)年前[2]と推定されている。このうちYはアイヌを含むオホーツク海沿岸に多い（詳細はハプログループY (mtDNA)を参照）。ユーラシア北部が起源とされるハプログループN9は、日本人の約7%が該当します。 主に北東アジアに分布しているが、一部（特にY2aとN9a6）が東南アジアに分布している。日本には比較的古い時代にやってきて縄文人になったグループと、 比較的新しい時代にやってきてオホーツク文化を形成したグループ等がいると考えられており、古代から魚を食していたといわれている[3][4][5]。
N9aの最も近い共通祖先はBehar et al. (2012)によれば今より17520.4 (SD 4389.8)年前[1]と、FTDNAによれば今より17,292 (99% CI 19,254 - 15,454）年前の者と推定されている[2]。現代日本（4.4%[6]、4.57%[7]）と現代中国（漢族 4.343%[8]）と現代韓国（3.91%[7]、4.32%[9]）ではN9aが総人口に占める割合は同程度だが、日本ではN9a2（2.6%）やN9a4a（0.8%）やN9a5（0.4%）やN9a7（0.2%）が多いのに対し、中国の漢族ではN9a1（1.320%）やN9a10（0.683%）やN9a3（0.549%）やN9a9（0.406%）が多い。N9a6は東南アジア（マレーシア・インドネシア・ベトナム・ラオス・タイ王国・カンボジア・フィリピン）に特有のハプログループとなっている。
N9bの最も近い共通祖先はBehar et al. (2012) によれば今より14885.6 (SD 4092.5)年前[1]と、FTDNAによれば今より14,176 (99% CI 16,917 - 11,718）年前[2]と推定されている。N9bは縄文人及びその後裔に特有のミトコンドリアDNAハプログループとされている。
下位系統
- N9
- N9a：東アジア、中央アジア、東南アジア
- N9a1'3 (N9a+G16129A!)
- N9a1 (N9a+G16129A!+T4386C+C16111T) 中国（漢族 1.320%[8]）
- N9a1f (N9a1+T16298C) 中国[10]
- N9a1+G12007A 中国[2]、ベトナム[2]、日本[2]（東北・近畿・計0.2%[6]、東京都・愛知県[10]）
- N9a1a (N9a1+G12007A+A15095G) 中国[2]（湛江市漢族等[10]、漢族 0.074%[8]）
- N9a1b (N9a1+G12007A+G7897A) 中国[2]
- N9a1c (N9a1+G12007A+G15355A) 日本[2]
- N9a1d (N9a1+G12007A+G513A+G709A+C13578T) 中国[2]
- N9a1+G12007A+A745G
- N9a1+G12007A+C12801T
- N9a1+G12007A+A8706G
- N9a1+G12007A+T961C
- N9a1+G12007A+G8027A
- N9a1+G12007A+G10373A
- N9a1+G12007A+C16327T
- N9a1+G12007A+G16391A
- N9a1+G12007A+G7852A
- N9a3 (N9a+G16129A!+A4129G) 中国[10]、日本（沖縄・中部北陸・計0.2%[6]）
- N9a3+A12612G インド[10]
- N9a3+A12612G+T12354C グルジア[10]、ロシア[2]（チェチェン共和国・イングーシ共和国・ブリヤート[10]）、中国[2]（四川省漢族[10]、漢族 0.549%[8]）、韓国（ソウル[10]）、日本（愛知県[10]）
- N9a3+A12612G+T12354C+T10321C 中国（漢族 0.088%[8]）
- N9a3+A12612G+T12354C+C7810T 中国（黒竜江省ダウール族[10]）、ロシア（バシコルトスタン[10]）、リトアニア[10]、ポーランド（ユダヤ人[10]）
- N9a3+A12612G+T12354C+A4913G 中国（ウイグル族[10]）
- N9a3+A12612G+T12354C+A9362G 日本（東京都等[10]）、中国（黒竜江省ダウール族・新疆ウイグル族[10]、山西省漢族1人・江蘇省漢族2人・計0.014%[8]）
- N9a3+A12612G+T12354C+A9632G タイ王国（Mon族[10]）
- N9a3+A12612G+T12354C+C13890T 中国（福建省漢族[10]、吉林省漢族1人・遼寧省漢族1人・広東省漢族2人・浙江省漢族2人・上海市漢族1人・計0.032%[8]）
- N9a3+A12612G+T12354C+T3338C 中国（北京市漢族[10]）、シンガポール[10]
- N9a3+A12612G+T12354C+T16311C! 中国（遼寧省漢族1人・安徽省漢族1人・湖南省漢族1人・江蘇省漢族3人・山東省漢族1人・浙江省漢族1人・計0.037%[8]）
- N9a3+A12612G+T12354C グルジア[10]、ロシア[2]（チェチェン共和国・イングーシ共和国・ブリヤート[10]）、中国[2]（四川省漢族[10]、漢族 0.549%[8]）、韓国（ソウル[10]）、日本（愛知県[10]）
- N9a3+A12612G インド[10]
- N9a1 (N9a+G16129A!+T4386C+C16111T) 中国（漢族 1.320%[8]）
- N9a2'4'5'11 (N9a+T16172C)
- N9a2 (N9a+T16172C+T961C+T15067C) 日本[2]（北海道・東北・中部北陸等・計2.6%[6]、東京都等[10]）、韓国[10]、中国[2]（漢族 0.365%[8]、フルンボイル市バルガ族・黒竜江省ダウール族・北京市漢族等[10]）、カザフスタン[10]、キルギス[10]、ハンガリー[10]（TMRCA 10361.1 [SD 3419.2]年前[1]）
- N9a2a (N9a2+A16497G) 韓国[2][10]、日本[2]（北海道・東北・関東甲信越・中部北陸・近畿・九州・計1.9%[6]）、アメリカ合衆国[10]、中国（漢族 0.134%[8]）
- N9a2b (N9a2+C12697T) 中国[10]
- N9a2c (N9a2+A13857G) 日本[10]
- N9a2d (N9a2+A3537G) 韓国[10]、中国（河北省漢族1人・計0.0046%[8]）
- N9a2e (N9a2+C10736T) 中国[10]（天津市漢族1人・黒竜江省漢族1人・安徽省漢族1人・北京市漢族1人・山東省漢族2人・河南省漢族1人・四川省漢族1人・計0.037%[8]）
- N9a4 (N9a+T16172C+G1664A+G16145A+C16245T) マレーシア[2]、中国（漢族 0.166%[8]）
- N9a5 (N9a+T16172C+A3729G+G15883A+T16189C!+T16209C) 日本（東北・関東甲信越・中部北陸・計0.4%[6]）
- N9a11 (N9a+T16172C+T195C!+T6092C+A9180G+G10801A+C13934T+T14581C+T16311C!) ラオス（ルアンパバーン[10]）、中国（漢族 福建省2人・広東省2人・湖北省1人・浙江省2人・河南省1人・河北省1人・江蘇省1人・計0.046%[8]）
- N9a2 (N9a+T16172C+T961C+T15067C) 日本[2]（北海道・東北・中部北陸等・計2.6%[6]、東京都等[10]）、韓国[10]、中国[2]（漢族 0.365%[8]、フルンボイル市バルガ族・黒竜江省ダウール族・北京市漢族等[10]）、カザフスタン[10]、キルギス[10]、ハンガリー[10]（TMRCA 10361.1 [SD 3419.2]年前[1]）
- N9a6 (N9a+T4856C+C16292T) マレーシア（クランタン州マレー人[10]）
- N9a6+A15080G タイ王国（ラワ族・北タイ人[10]）、ベトナム（ホーチミン市キン族等[10]）、カンボジア（クメール人[10]）、インドネシア（スンダ族[10]）、フィリピン（アクラン州[10]）、アメリカ合衆国[10]
- N9a6a (N9a6+A15080G+C13742T+C16294T) タイ王国（マレー人[10]）、カンボジア（クメール人[10]）
- N9a6+A15080G+A14587G ベトナム（スティエン族等[10]）
- N9a6+A15080G+C16354T ベトナム[10]
- N9a6b (N9a6+G10530C+G14364A+T16342C) マレーシア（オランセレター[10]）
- N9a6c (N9a6+T13812G) タイ王国（プータイ族[10]）、カンボジア（クメール人[10]）
- N9a6d (N9a6+G3849A) マレーシア（ヌグリスンビラン州ミナンカバウ人[10]）
- N9a6d1 (N9a6d+C3359T) ベトナム（ヌン族・キン族[10]）
- N9a6e (N9a6+T961C) ベトナム（キン族[10]）
- N9a6f (N9a6+G13604C)
- N9a6g (N9a6+G3010A) インドネシア（スマトラ島Semende族[10]）、タイ王国（中部タイ人[10]）
- N9a6h (N9a6+A14203G) タイ王国（プータイ族・Soa族[10]）
- N9a6+A15080G タイ王国（ラワ族・北タイ人[10]）、ベトナム（ホーチミン市キン族等[10]）、カンボジア（クメール人[10]）、インドネシア（スンダ族[10]）、フィリピン（アクラン州[10]）、アメリカ合衆国[10]
- N9a7 (N9a+G14016A+C16291T) 日本[2]（東北・中部北陸・計0.2%[6]、東京都等[10]）
- N9a8 (N9a+T11368C+T15090C) 中国（漢族 0.208%[8]）（TMRCA 12,452 [99% CI 15,645 - 9,680]年前[2]）
- N9a9 (N9a+T2887C) 中国（漢族 0.406%[8]、北京市漢族・河南省漢族[10]）
- N9a9a (N9a9+G228T) ルーマニア（ドブロジャ地方人骨2体[10]）
- N9a9b (N9a9+T6011C) ハンガリー（今より約1000年前の人骨1体と今より約900年前の人骨1体[10]）、中国（新疆ウイグル自治区ニルカ県出土の今より約2600年前の人骨NLKTBSY_M7[10]）、ロシア（イングーシ共和国イングーシ族[10]）、ウクライナ[2]（ヴィーンヌィツャ州[10]）
- N9a9c (N9a9+A5319G)
- N9a9c1 (N9a9c+C3588T) 中国[10]
- N9a9d (N9a9+C14664T) 台湾[10]
- N9a9+T16519C! 中国[2]、ロシア[2]
- N9a10 (N9a+G12771A) 中国[10]（漢族 0.683%[8]、ミャオ族 9.0%・チワン族 4.4%・南方漢族 1.9%[11]）、ベトナム（ホーチミン市キン族[10]）
- N9a10+T16311C! 中国（重慶市漢族[10]）
- N9a10+T16311C!+C15094T 中国（江蘇省[10]）
- N9a10+T16311C!+C9740T カンボジア（バタンバン州チャム人・コンポントム州クメール人[10]）、ベトナム（ヌン族[10]）、台湾（漢族[10]）
- N9a10+T16311C!+G9738A ベトナム（Hmong族[10]）、タイ王国（Hmong族[10]）、ラオス（Hmong族[10]）、中国（貴州省ミャオ族[10]）
- N9a10b (N9a10+T16311C!+G6899A) 中国（漢族 0.088%[8]）
- N9a10a (N9a10+G9755A) 中国[2]（漢族 0.055%[8]）
- N9a10c (N9a10+C14691T) タイ王国（北タイ人[10]）
- N9a10d (N9a10+A12534G) タイ王国（中部タイ人・北東部タイ人[10]）、中国[10]
- N9a10e (N9a10+A1027G) 中国[10]（漢族 0.231%[8]）
- N9a10f (N9a10+G9055A+C9740T) 中国（漢族 広西チワン族自治区1人・湖南省3人・重慶市1人・広東省3人・福建省1人・浙江省2人・江蘇省1人・計0.055%[8]）
- N9a10+T16311C! 中国（重慶市漢族[10]）
- N9a12 (N9a+T5063C) 中国[10]
- N9a13 (N9a+C7376T) 台湾[10]、中国（漢族 0.097%[8]）
- N9a13a (N9a13+A14251G) タイ王国（タイルー族[10]）
- N9a14 (N9a+A13862G) 中国[10]
- N9a15 (N9a+G1888A) 中国（新疆漢族1人・広東省漢族2人・四川省漢族1人・浙江省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.028%[8]）
- N9a16 (N9a+A13927T)
- N9a16a (N9a16+C8794T) タイ王国（コンムアン[10]）
- N9a17 (N9a+T204d)
- N9a1'3 (N9a+G16129A!)
- N9b：日本、沿海州
- Y：
- N9a：東アジア、中央アジア、東南アジア
脚注
- 1 2 3 4 Behar DM, van Oven M, Rosset S, Metspalu M, Loogväli EL, Silva NM, Kivisild T, Torroni A, Villems R. A "Copernican" reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Am J Hum Genet. 2012 Apr 6;90(4):675-84. doi: 10.1016/j.ajhg.2012.03.002. Erratum in: Am J Hum Genet. 2012 May 4;90(5):936. PMID 22482806; PMC PMC3322232.
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 FamilyTreeDNAによるミトコンドリアDNAハプログループN9の系統樹
- ↑ https://web.archive.org/web/20111209150338/http://www.ianlogan.co.uk/mtDNA.htm
- ↑ https://dena.com/jp/article/003157
- ↑ https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC524407/
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Yamamoto, K., Sakaue, S., Matsuda, K. et al. "Genetic and phenotypic landscape of the mitochondrial genome in the Japanese population." Commun Biol 3, 104 (2020). https://doi.org/10.1038/s42003-020-0812-9
- 1 2 Tanaka, Masashi; Cabrera, Vicente M.; González, Ana M.; Larruga, José M.; Takeyasu, Takeshi; Fuku, Noriyuki; Guo, Li-Jun; Hirose, Raita et al. (2004-10). “Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan”. Genome Research 14 (10A): 1832–1850. doi:10.1101/gr.2286304. ISSN 1088-9051. PMC 524407. PMID 15466285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15466285/.
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 Yu-Chun Li, Wei-Jian Ye, Chuan-Gui Jiang, Zhen Zeng, Jiao-Yang Tian, Li-Qin Yang, Kai-Jun Liu, and Qing-Peng Kong, "River Valleys Shaped the Maternal Genetic Landscape of Han Chinese," Molecular Biology and Evolution, Volume 36, Issue 8, August 2019, Pages 1643–1652, https://doi.org/10.1093/molbev/msz072
- ↑ Noriyuki Fuku, Kyong Soo Park, Yoshiji Yamada et al., "Mitochondrial Haplogroup N9a Confers Resistance against Type 2 Diabetes in Asians", Am. J. Hum. Genet. 2007; 80:407–415. DOI: 10.1086/512202
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 YFull MtDNA Haplotree v.1.02.3454 (as of October 23, 2020)
- ↑ Huang X, Xia Z-Y, Bin X, He G, Guo J, Adnan A, Yin L, Huang Y, Zhao J, Yang Y, Ma F, Li Y, Hu R, Yang T, Wei L-H and Wang C-C (2022), "Genomic Insights Into the Demographic History of the Southern Chinese." Front. Ecol. Evol. 10:853391. doi: 10.3389/fevo.2022.853391
| ミトコンドリア・イブ (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1 | L5 | L2 | L6 | L4 | L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M7 | M8 | M9 | D | G | Q | N1 | N2 | N9 | A | O | S | X | R | ||||||||||||||||||||||||||
| M7a | C | Z | E | I | W | Y | R0 | R9 | B | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||||
| HV | F | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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