ハプログループA (mtDNA)
From Wikipedia, the free encyclopedia
下位系統のA2はチュクチ・カムチャツカ系民族とアメリカ先住民に高頻度に見られる[3][2]。
その他の系統A(xA2)はそれほど高頻度でないが、アジアにおいて広くみられる[4][5]。アジアでは、A(xA2)は特に、中国南西部、チベット人などのチベット・ビルマ系民族に比較的多く(6/65 = 9.2%,[3] 25/216 = 11.6%,[6] 11/73 = 15.1%[6])みられる。また朝鮮民族の約8.0%[7][5][8][9][10] 、漢民族の約7.320%[11]、日本人の約6.7%[12]~6.86%[13](3.9% 平取町アイヌ、5.0% 東海、6.0% 北海道、6.6% 九州北部、6.7% 沖縄、6.8% 東京、6.95% 岐阜県立病院にて受診をした人[5]、8.6% 東北[3][14][15][16])、モンゴル人の約6.36%[17][9][10][8]が属す。ベトナム人[9]、タタール人[18]、トルコ人[19]、ペルシャ人、タジク人[8] など、アジア大陸では広く見られるが、オーストロネシア系民族(マレー諸島)[20]ではほとんど見られない。
現代日本に於けるハプログループAはA5a(A5をベースとして2156.1AとG4655AとC11647Tの変異を有するミトコンドリアDNA)が断然と多く、現代日本人全体の約4.0%を占めている。A5aは日本以外に韓国でも見られる。[21][22] 現代日本で見られるハプログループAのサブクレードはかなり多様だがA5a以外の系統はおしなべて割合が小さく、その中で比較的多く見られるものはA3(0.6%)、A5c(0.4%)、A5b1a(0.4%)。[12]
下位系統
- A (N+A235G+A663G+A1736G+T4248C+A4824G+C8794T+C16290T+G16319A)
- A10 (A+T5393C+C7468T+G9948A+C10094T+A16227C)
- A5 (A+A8563G+C11536T)
- A5a (A5+T2150TA+G4655A+C11647T) 日本(4.0%[12]、東京都・愛知県等[21])、韓国[21](3.5%[7])、中国(漢族 0.157%[11])
- A5a1 (A5a+C14944T) 韓国[21]
- A5a2 (A5a+T13461C) 日本(東京都・愛知県等[21])
- A5a3 (A5a+A12909G) アメリカ合衆国(黒人[21])
- A5a4 (A5a+G10325A) 日本[21]、アメリカ合衆国[21]
- A5a4a (A5a4+T10235C) 日本(愛知県等[21])
- A5a5 (A5a+C7694T) 日本[21]、韓国(ソウル[21])、中国(ウイグル族[21]、遼寧省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.009%[11])
- A5a5a (A5a5+C16360T) 日本[21]
- A5a6 (A5a+C16174T) 韓国[21]
- A5a7 (A5a+C14425T) 中国[21]
- A5a8 (A5a+T8598C) 韓国[21]
- A5a9 (A5a+C13809T) 韓国[21]
- A5b (A5+T961C) 中国(漢族 0.951%[11])
- A5c (A5+T152C!+G16129A!+G16213A) 日本(東北地方等・計0.4%[12]、愛知県等[21])、中国(バルガ族[21]、漢族 0.069%[11])、ロシア[22](ブリヤート・ハムニガン[21])
- A5a (A5+T2150TA+G4655A+C11647T) 日本(4.0%[12]、東京都・愛知県等[21])、韓国[21](3.5%[7])、中国(漢族 0.157%[11])
- A8 (A+C16242T) コロンビア(デサノ族[21])
- A8a (A8+C64T+T146C!) 日本(東北・中部北陸・計0.2%[12])、韓国[21]、中国(漢族 0.097%[11]、貴州省漢族・遼寧省[21])
- A8a1 (A8a+T152C!+G6962A+G8865A+A12777G) 中国(吉林省漢族1人・湖北省漢族1人・計0.009%[11]、ウイグル族[21])
- A8a2 (A8a+A6779G)
- A8b (A8+T12175C) ロシア(カムチャツカ地方コリャーク[21])
- A8a (A8+C64T+T146C!) 日本(東北・中部北陸・計0.2%[12])、韓国[21]、中国(漢族 0.097%[11]、貴州省漢族・遼寧省[21])
- A-a (A+T152C!)
- A11 (A+C9650T+A16293C) 中国(漢族 0.286%[11])、日本(北海道・東北・中部北陸・計0.2%[12])
- A3 (A+T2857C+A8962G+C9711T) 日本(東北・中部北陸・近畿等・計0.6%[12]、東京都等[21])、韓国[21]、アメリカ合衆国[21]、中国(吉林省漢族1人・安徽省漢族1人・上海市漢族1人・四川省漢族1人・計0.018%[11])
- A7 (A+A16051G+T146C!) 中国[21](漢族 0.097%[11])、韓国[7]
- A+T16362C
- A+T16362C* 日本[21](東北・関東甲信越・中部北陸・計0.2%[12])、韓国[21]、中国(河南省漢族・河北省・内モンゴル自治区バルガ族等[21])、カザフスタン[21]
- A1 (A+T152C!+T16362C+G1442A) 日本(中部北陸等・計0.2%[12])
- A1a (A1+G9713A+T16249C) 日本[22](関東甲信越・計0.1%[12]、愛知県[21])、中国(タシュクルガンタジク自治県サリコリタジク人[21])、スリランカ[22]、イタリア[22]
- A1b (A1+T471C) 韓国[21]、日本[21]
- A15 (A+T152C!+T16362C+G207A+G263A+A8459G+T16111C!) 中国[21]、韓国[7]
- A16
- A18
- A19
- A2 アメリカ大陸先住民
- A20 (A+T152C!+T16362C+A14696G) 日本[21](東北地方・計0.1%[12])、中国(陝西省漢族1人・河南省漢族1人等・計0.032%[11])
- A21
- A22
- A24
- A25
- A26
- A6 (A+T16362C+T654C+C3687T+C13287T) 韓国[21]、中国(チベット自治区出土の今より約3262年前の人骨1体と今より約1800年前の人骨1体・現代僜人[21])
- A+A200G
- A+A200G* 日本[21](北海道・東北・中部北陸・計0.2%[12])、韓国[21]、インド(ラダック[21])、パラグアイ(アルトパラナ県[21])
- A13 (T3504C) 中国(漢族 0.198%[11])
- A14 (C151T+A735G) 中国(新疆ウイグル自治区出土の今より約2180年前の人骨1体・現代の新疆ウイグル族等[21]、雲南省プーアル市ワ族・徳宏トーアン族[23]、漢族 0.614%[11])、ロシア(トゥヴァ共和国バイタル村トゥヴァ人・ブリヤート共和国[21])、タイ王国(ムアンロッブリー郡Mon族[21])、ミャンマー(チン族8.0%・ビルマ族2.8%・ラカイン族2.0%・計3.8%[23])
- A14a (A14+T6671C) 中国[21](河北省漢族1人・計0.0046%[11])、シンガポール[21]
- A14b (A14+G7805A) ロシア(アルタイ人[21])、中国[21](漢族 0.060%[11])
- A14c (A14+A16463G) 中国(漢族 0.143%[11]、新疆ウイグル族等[21])
- A14c1 (A14c+C16176T) 中国[21]
- A14d (A14+C16264T) 中国[21](漢族 0.065%[11])
- A14e (A14+C182T!!) タイ王国(中部タイ人[21])
- A14f (A14+C16365T) 中国(新疆ウイグル族[21]、四川省漢族1人・浙江省漢族1人・計0.009%[11])
- A14g (A14+A12004G) キルギス[21]、中国(アルトゥシュ市キルギス族・新疆ウイグル族[21])
- A14h (A14+C3363T)
- A14i (A14+T12519C)
- A14j (A14+C16256T)
- A14k (A14+G6734A) 中国(四川省漢族1人・計0.0046%[11])
- A14l (A14+T12705d)
- A+A200G+A7298G
- A+A200G+A10750G
- A+A200G+T10882C
- A+A200G+G8251A
- A+A200G+T13602C
- A+T16189C!
- A+G3834A
- A+G16125A
- A+A6890G
- A+A9033G
- A+G11914A!
- A+T8686C
- A+A10967G
- A+T9126C
- A+T3732C
- A+G3483A
- A+C9317T
- A+C7493T
- A+A4243G
- A+T10275C
- A+A16525C
- A+T5794C
| ミトコンドリア・イブ (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1 | L5 | L2 | L6 | L4 | L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M7 | M8 | M9 | D | G | Q | N1 | N2 | N9 | A | O | S | X | R | ||||||||||||||||||||||||||
| M7a | C | Z | E | I | W | Y | R0 | R9 | B | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||||
| HV | F | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
脚注
- ↑ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. Retrieved 2009-05-20.
- 1 2 Fagundes, Nelson J.R.; Ricardo Kanitz, Roberta Eckert, Ana C.S. Valls, Mauricio R. Bogo, Francisco M. Salzano, David Glenn Smith, Wilson A. Silva, Marco A. Zago, Andrea K. Ribeiro-dos-Santos, Sidney E.B. Santos, Maria Luiza Petzl-Erler, and Sandro L.Bonatto (2008). "Mitochondrial Population Genomics Supports a Single Pre-Clovis Origin with a Coastal Route for the Peopling of the Americas" (PDF). American Journal of Human Genetics 82 (3): 583–592. doi:10.1016/j.ajhg.2007.11.013. PMC 2427228. PMID 18313026. Retrieved 2009-11-19.
- 1 2 3 Tanaka, Masashi et al. (2004). "Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan". Genome Research 14 (10A): 1832–1850. doi:10.1101/gr.2286304. PMC 524407. PMID 15466285.
- ↑ Ville N Pimenoff, David Comas, Jukka U Palo et al., "Northwest Siberian Khanty and Mansi in the junction of West and East Eurasian gene pools as revealed by uniparental markers", European Journal of Human Genetics (2008) 16, 1254–1264; doi:10.1038/ejhg.2008.101
- 1 2 3 Noriyuki Fuku, Kyong Soo Park, Yoshiji Yamada et al., "Mitochondrial Haplogroup N9a Confers Resistance against Type 2 Diabetes in Asians", Am. J. Hum. Genet. 2007; 80:407–415. DOI: 10.1086/512202
- 1 2 Fuyun Ji, Mark S. Sharpley, Olga Derbeneva et al., "Mitochondrial DNA variant associated with Leber hereditary optic neuropathy and high-altitude Tibetans", PNAS (May 8, 2012), vol. 109, no. 19, 7391–7396. doi: 10.1073/pnas.1202484109
- 1 2 3 4 5 TheYtree
- 1 2 3 Miroslava Derenko, Boris Malyarchuk, Tomasz Grzybowski et al., "Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations", Am. J. Hum. Genet. 2007;81:1025–1041. DOI: 10.1086/522933
- 1 2 3 Han-Jun Jin, Chris Tyler-Smith and Wook Kim, "The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers" PLoS ONE (2009)
- 1 2 Qing-Peng Kong, Yong-Gang Yao, Mu Liu et al., "Mitochondrial DNA sequence polymorphisms of five ethnic populations from northern China", Hum Genet (2003) 113 : 391–405. doi:10.1007/s00439-003-1004-7
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 Yu-Chun Li, Wei-Jian Ye, Chuan-Gui Jiang, Zhen Zeng, Jiao-Yang Tian, Li-Qin Yang, Kai-Jun Liu, and Qing-Peng Kong, "River Valleys Shaped the Maternal Genetic Landscape of Han Chinese," Molecular Biology and Evolution, Volume 36, Issue 8, August 2019, Pages 1643–1652, https://doi.org/10.1093/molbev/msz072
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 Yamamoto, K., Sakaue, S., Matsuda, K. et al. "Genetic and phenotypic landscape of the mitochondrial genome in the Japanese population." Commun Biol 3, 104 (2020). https://doi.org/10.1038/s42003-020-0812-9
- ↑ Tanaka, Masashi; Cabrera, Vicente M.; González, Ana M.; Larruga, José M.; Takeyasu, Takeshi; Fuku, Noriyuki; Guo, Li-Jun; Hirose, Raita et al. (2004-10). “Mitochondrial genome variation in eastern Asia and the peopling of Japan”. Genome Research 14 (10A): 1832–1850. doi:10.1101/gr.2286304. ISSN 1088-9051. PMC 524407. PMID 15466285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15466285/.
- ↑ Kazuo Umetsu, Masashi Tanaka, Isao Yuasa et al., "Multiplex amplified product-length polymorphism analysis of 36 mitochondrial single-nucleotide polymorphisms for haplogrouping of East Asian populations", Electrophoresis (2005), 26, 91–98. DOI 10.1002/elps.200406129
- ↑ Asari M et al., "Utility of haplogroup determination for forensic mtDNA analysis in the Japanese population", Leg Med (2007), doi:10.1016/j.legalmed.2007.01.007
- ↑ Zheng H-X, Yan S, Qin Z-D, Wang Y, Tan J-Z, et al. 2011 Major Population Expansion of East Asians Began before Neolithic Time: Evidence of mtDNA Genomes. PLoS ONE 6(10): e25835. doi:10.1371/journal.pone.0025835
- ↑ Cardinali I, Bodner M, Capodiferro MR, Amory C, Rambaldi Migliore N, Gomez EJ, Myagmar E, Dashzeveg T, Carano F, Woodward SR, Parson W, Perego UA, Lancioni H, and Achilli A (2022), "Mitochondrial DNA Footprints from Western Eurasia in Modern Mongolia." Front. Genet. 12:819337. doi: 10.3389/fgene.2021.819337
- ↑ Boris Malyarchuk, Miroslava Derenko, Galina Denisova, and Olga Kravtsova, "Mitogenomic Diversity in Tatars from the Volga-Ural Region of Russia", Mol. Biol. Evol. 27(10):2220–2226. (2010) doi:10.1093/molbev/msq065
- ↑ Marchani, EE; Watkins, WS; Bulayeva, K; Harpending, HC; Jorde, LB (2008). “Culture creates genetic structure in the Caucasus: Autosomal, mitochondrial, and Y-chromosomal variation in Daghestan”. BMC genetics 9: 47. doi:10.1186/1471-2156-9-47. PMC 2488347. PMID 18637195. https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2488347/.
- ↑ Kristina A. Tabbada, Jean Trejaut, Jun-Hun Loo et al., "Philippine Mitochondrial DNA Diversity: A Populated Viaduct between Taiwan and Indonesia?", Mol. Biol. Evol. 27(1):21–31. (2010) doi:10.1093/molbev/msp215
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 YFullによるミトコンドリアDNAハプログループAの系統樹
- 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 FamilyTreeDNAによるミトコンドリアハプログループAの系統樹
- 1 2 He, Y., Zhang, X., Peng, MS. et al. Genome diversity and signatures of natural selection in mainland Southeast Asia. Nature (2025). https://doi.org/10.1038/s41586-025-08998-w
この項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めています(プロジェクト:生命科学/Portal:生物学)。 |