ハプログループD (mtDNA)
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ハプログループDは48000年前に東アジアで誕生し、東アジア・東南アジア・北アジア・中央アジアそしてアメリカ大陸に至るまで広範囲に観察される。形質人類学におけるモンゴロイドの分布域と概ね重なる。日本人の約40%がこの系統に属し[4][5][6][7]、D4は日本人の35%以上が属す最も高頻度のグループとなっているが、D5は僅か5%程度となっている[8][9][10][11][12][13]。長寿の傾向がある遺伝子とされている[8][9][10][11][12][13]。日本以外では朝鮮半島（韓国 28.86% D4・3.54% D5・32.59% D[14]; 26.6% D4・7.4% D5・34.0% D[6]; 34.19% D[15]）や中国（漢族 16.624% D4・6.350% D5・0.305% D6・23.279% D[16]）にも多く、東アジア集団を特徴づけるグループといえる。D4のサブクレードであるD1とD4h3aはパレオインディアンの遺骨でも現代アメリカ大陸先住民の間でも広く分布しているが、D4e1のサブクレードであるD2とD4b1cのサブクレードであるD3は北アジア及びアメリカ大陸北辺（エスキモー・アレウト）にまたがって分布している。
日本で見られるmtDNAハプログループDのサブクレードは多種多様だが、特にD4a1（5.3%[4]）、D4e2（5.3%[4]）、D4b2b1（5.1%[4]）、D4g1（3.1%[4]）、D4c1（2.7%[4]）、D4b2a（2.0%[4]）、D4a2（1.1%[4]）、D4b1a1（1.0%[4]）、D5a1（1.0%[4]）が多い。
下位系統
大別すると「D4」と「D5・D6」という2つの系統がある。
- D
- D4 (3010, 8414, 14668): 日本人で最も多いグループであり[8][9][10][11][12][13]、北東アジアでよくみられ、日本人、朝鮮民族などでは最も高頻度で観察されるタイプであり、とりわけ日本人に於いてその頻度が高い。[7][6][17][18][19][5][20] ウィルタ、ブリヤート、カルムイク人、テレンギト人などでも最もよく見られるタイプである[17][21]。中国・中国西部・中央アジア、アメリカ先住民で広く観察される[22][23][24][25][26][27][28]。パレオ・インディアンやロシア沿海州（悪魔の門）及び中国東北部の新石器時代初期の遺跡（吉林省大安市にあるホウタオムガ遺跡、内モンゴル自治区通遼市にあるハミンマンハ遺跡等）でも最も頻繁に見られるハプログループである。
- D1 アメリカ先住民
- D4a 日本（7.7%[4]、8.7%[6]、9.1%[29]）、韓国（4.9%[6]、5.1%[29]）、中国（3.240%[16]）、タイ王国（バンコク）
- D4a1 日本[30]（5.3%[4]）、韓国[31]、中国（0.125%[16]）[31]、台湾（稀）[31]、ロシア（ネギダール1人[31]）、アメリカ合衆国（稀）[31]
- D4a1a 日本[30]（1.4%[4]）、韓国[30]、中国（0.023%[16]）
- D4a1b 日本[30][31]（1.0%[4]）、中国（0.046%[16]）
- D4a1c 韓国[30]、日本[30]（0.5%[4]）、中国（0.014%[16]）
- D4a1d 日本[30]（0.2%・東北地方・中部北陸地方[4]、千葉県[31]、東京都[31]、愛知県[31]、鳥取県[31]）
- D4a1e 中国（黒竜江省ダウール族1人[31]、漢族1人[31]）、台湾（漢族1人[31]）、インド（ディラングモンパ族1人[31]）、ロシア[30]（ヤクート1人[31]）
- D4a1f 日本[30][31]
- D4a1g 中国（バルガ族1人[31]、食道癌患者1人[31]、天津市漢族1人[16]、江西省漢族1人[16]）
- D4a1h 日本[30]（千葉県等[31]）、韓国1人[31]
- D4a1i （D4a1+T16093C） 韓国[31]、アメリカ合衆国[31]
- D4a1j （D4a1+C16320T） 日本（東京都[31]）
- D4a1k （D4a1+T16086C）
- D4a1l （D4a1+T593C） 韓国[30]、日本[30]
- D4a1m （D4a1+A735G） 日本[30]
- D4a2 日本[30]（1.1%[4]、愛知県等[31]）
- D4a3
- D4a4 日本[30]（0.3%・九州地方・近畿地方・中部北陸地方[4]、東京都等[31]）
- D4a5 中国（チャムド市チベット人等[31]、漢族 0.258%[16]）、ミャンマー[31]
- D4a6 中国[30]（0.286%[16]）、モーリシャス[30]
- D4a7 中国（貴州省ミャオ族・湖南省漢族[31]、漢族 0.369%[16]）、台湾（漢族・ツォウ族[31]）、ベトナム（キン族[31]）
- D4a8 中国[30]（福建省漢族[31]、漢族 0.097%・主に台湾及び福建省[16]）、台湾（漢族[31]）
- D4a9 日本[30]、韓国[31]、中国[30]（北京市漢族等[31]）
- D4a10 (D4a+A5582G) タイ王国[31]、ベトナム（Mang族[31]）、中国（広東省客家等[31]）、シンガポール[31]
- D4a11 (D4a+C9518T) ラオス[31]
- D4a12 (D4a+A16162G) 中国[31]、アメリカ合衆国[31]
- D4a13 (D4a+C6551T) 韓国[30][31]、日本[30][31]
- D4a14 (D4a+G5054C) 中国[31]
- D4a15 (D4a+T6965C) 中国[31]
- D4a16 (D4a+C14485T) 中国[31]
- D4a18 (D4a+G225A) 韓国[31]
- D4a1 日本[30]（5.3%[4]）、韓国[31]、中国（0.125%[16]）[31]、台湾（稀）[31]、ロシア（ネギダール1人[31]）、アメリカ合衆国（稀）[31]
- D4b 日本（10.6%[4]、9.4%[6]、6.6%[29]）、韓国（6.1%[29]、6.9%[6]）、中国（漢族 3.987%[16]）
- D4b1 日本[30]
- D4b2 TMRCA 16567.3（SD 2692.7）年前[32]
- D4b2a 日本[30][31]（2.0%[4]）、韓国[31]、中国（0.042%[16]）、キルギス[31]、アメリカ合衆国[30][31]
- D4b2b TMRCA 12932.3（SD 2805.2）年前[32]
- D4b2b1 日本[30][31]（5.1%[4]）、韓国[31]（群山市の朝鮮三国時代・六世紀中葉の甕棺墓に埋葬された1体の遺骨[33]）、中国（漢族 0.097%[16]、ウイグル族[31]）、ロシア（ブリヤート[31]）、イラン（ペルシア人[31]）
- D4b2b2 中国（0.683%[16]）
- D4b2b3 日本[30]（0.3%・東北地方・中部北陸地方[4]、愛知県・東京都等[31]）
- D4b2b4 ロシア[30]（トゥヴァ[31]）、中国[30]（四川省プミ族・湖南省漢族等[31]）、インド（シェルドゥクペン族[31]）
- D4b2b5 ロシア[30]（ハムニガン・ブリヤート[31]）、中国[30]（バルガ族・僜族等[31]）、台湾[30]
- D4b2b6 中国[30]（0.286%[16]）、韓国[31]、モンゴル[31]、カザフスタン[31]、アルメニア[31]
- D4b2b7 中国[30]（福建省・浙江省[31]）、台湾（客家[31]）
- D4b2b8 (D4b2b+G14384A) 中国[31]、サウジアラビア[31]
- D4b2b9
- D4b2b10
- D4b2b11
- D4b2b12
- D4b2b13
- D4b2b14
- D4b2b15 中国、韓国
- D4b2b22
- D4b2d 中国[31]
- D4c
- D4d 韓国[30]、日本[30]（0.1%・関東甲信越地方[4]、愛知県[31]）、中国（黒竜江省ダウール族[31]）
- D4e
- D4e1'3 (D4e+C9536T)
- D4e1 トルコ[30]、中国（福建省[31]、新疆ウイグル自治区出土の今より約2553年前の人骨1体[31]、漢族 1.05%[16]）、台湾[31]、シンガポール[31]、ロシア（バシコルトスタン[31]）、チェコ[31]、スウェーデン[31]
- D2 ロシア（チュクチ族・エスキモー等）、アメリカ合衆国（先住民等）、メキシコ、中国、スコットランド、ウェールズ、ドイツ、スイス
- D4e1a キルギス[31]、中国（アルトゥシュ市ウイグル族・チベット自治区僜族・河南省漢族[31]、漢族 0.669%[16]）、韓国[31]、日本（0.5%・北海道地方・東北地方・中部北陸地方等[4]、愛知県[31]）
- D4e1a1 日本[30]（0.2%・九州地方・中部北陸地方[4]、愛知県・東京都・山口県[31]）、中国（0.046%[16]）
- D4e1a1a (D4e1a1+A3316G!) 中国（江蘇省・上海市[31]）
- D4e1a2 中国（0.106%[16]）、シンガポール[31]
- D4e1a3 (D4e1a+T8119C) 中国（貴州省ミャオ族・湖南省漢族・巴馬ヤオ族自治県ヤオ族等[31]、漢族 0.157% [主に貴州省・四川省・重慶市][16]）、タイ王国（Hmong族・ヤオ族[31]）、ベトナム（フラ族・コーラオ族[31]）
- D4e1a+C16167T タイ王国（モーケン族・ウラクラウォイ族・中部タイ人等[31]）
- D4e1a+G8545A タイ王国（Mon族[31]）
- D4e1a1 日本[30]（0.2%・九州地方・中部北陸地方[4]、愛知県・東京都・山口県[31]）、中国（0.046%[16]）
- D4e1c (D4e1+G14207A) メキシコ[31]、中国（広西チワン族自治区漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4e1e (D4e1+G6366A+C16188T)
- D4e3 台湾[30][31]、中国[30]（0.226%[16]）、シンガポール[31]、インド（ラチュンパ[シッキム州チベット族][31]）
- D4e1 トルコ[30]、中国（福建省[31]、新疆ウイグル自治区出土の今より約2553年前の人骨1体[31]、漢族 1.05%[16]）、台湾[31]、シンガポール[31]、ロシア（バシコルトスタン[31]）、チェコ[31]、スウェーデン[31]
- D4e2 日本[30]（5.3%[4]）、韓国[30]、アメリカ合衆国（黒人1人[31]）、中国（黒竜江省ダウール族1人[31]、漢族 0.069%[16]）
- D4e2a 日本（0.8%・東北地方・関東甲信越地方・中部北陸地方・九州地方[4]、千葉県・東京都等[31]）、韓国（金海市大成洞12b号墓殉葬者 伽倻国 AKG_10204ことGimhae_KD12bの古人骨1体等）、中国（遼寧省漢族1人・河北省漢族1人・計0.009%[16]）
- D4e2b 日本[30]（東京都・愛知県[31]）
- D4e2c 日本[30]（0.3%・東北地方・中部北陸地方[4]、東京都等[31]）、中国（黒竜江省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4e2d 日本[30]（0.1%・中部北陸地方[4]、千葉県等[31]）
- D4e2e 日本（東京都・愛知県[31]）
- D4e2f 日本[31]
- D4e2g (D4e2+G16129A!) 日本[30]（東京都・千葉県・愛知県等[31]）、モンゴル[31]
- D4e4 (D4e+G14905A) ロシア（バシコルトスタン[31]）
- D4e4c (D4e+G14905A+G8573A) モンゴル[31]、キルギス[31]
- D4e4+A1935G ロシア（バシコルトスタン[31]）、カザフスタン[31]、インド（Dongri Bhill族[31]）、中国（新疆ウイグル自治区出土の今より約2400年前の人骨1体[31]）、オーストリア[30]
- D4e4a (D4e4+A1935G+A8683G) 中国（ウイグル族[31]、陝西省漢族2人・計0.009%[16]）
- D4e4+A1935G+T10667C ロシア（ヤクート[31]）
- D4e4+A1935G+A603G ウクライナ[31]、ポーランド[31]、アメリカ合衆国（デラウェア州[31]）
- D4e4b (D4e4+A1935G+G10310A+C12882T) ロシア（ロシア人・タタール等[31]）、モンゴル[31]
- D4e4e (D4e4+A1935G+T16263C) セルビア人[31]、ハンガリー[30]（今より約900年前の人骨1体と今より約1000年前の人骨1体[31]）、ポーランド[30]、ルーマニア[30]、ブルガリア[30]
- D4e5 中国（漢族 0.171%[16]）
- D4e6 (D4e+A3492G) 中国（湖南省[31]）
- D4e1'3 (D4e+C9536T)
- D4f 中国（0.138%[16]）
- D4g
- D4g1 日本（3.1%・北海道地方・東北地方・中部北陸地方・近畿地方等[4]、愛知県・茨城県・千葉県・東京都等[31]）、韓国[31]、中国（0.078%[16]）、カザフスタン[31]
- D4g2
- D4g2a 日本[30]（0.1%・東北地方[4]、東京都[31]）
- D4g2a1 ミャンマー（1.0%[36]）、中国（漢族 0.840%[16]）、日本（近畿地方・計0.1%[4]）
- D4g2a1a 日本[30]（千葉県・東京都[31]）、中国（江蘇省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4g2a1b タイ王国（タイルー族[31]）、中国（四川省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4g2a1c インド（ワンチョー族[31]、ジャンムーカシミール州[31]）、ミャンマー（ラカイン族・ナガ族[36]）、タイ王国（Mon族・タイユアン族）、中国（新疆ウイグル自治区の今より約2000年前の人骨2体及び約1125年前の人骨1体等[31]）
- D4g2a1d 中国（黒竜江省ダウール族等[31]）
- D4g2a1e (D4g2a1+T5655C) 中国[30]、タイ王国[30]（タイユアン族[31]）、ベトナム（Thai族[31]）
- D4g2a1f (D4g2a1+C14650T) ロシア[30]（ハムニガン族[31]）、中国（バルガ族[31]）、カナダ[31]
- D4g2a1 ミャンマー（1.0%[36]）、中国（漢族 0.840%[16]）、日本（近畿地方・計0.1%[4]）
- D4g2b トルコ[31]、中国（漢族 0.180%[16]）
- D4g2c ロシア[30]（カラチャイ人・オセット人[31]）、グルジア[31]、トルコ[31]、台湾[31]
- D4g2c1 (D4g2c+A13681G) 中国[31]
- D4g2d (D4g2+T294C) 中国（河南省漢族[31]）
- D4g2e
- D4g2f
- D4g2a 日本[30]（0.1%・東北地方[4]、東京都[31]）
- D4h
- D4i 日本（0.6%[4]）、中国（漢族 0.046%[16]）
- D4i1 日本[30]（0.2%・中部北陸地方[4]、東京都・愛知県[31]）、中国（広東省漢族1人・山東省漢族1人・計0.009%[16]）
- D4i2 イギリス[30]、ドイツ[30]、ハンガリー（今より約1300年前の人骨1体[31]）、ロシア[30]（ユカギール・タタール・ブリヤート・ヤクート[31]）、キルギス[31]、中国（ウイグル族・バルガ族[31]、江蘇省漢族2人・計0.009%[16]）
- D4i3 (D4i+T195C!+C4936T+A16318G) 中国（新疆ウイグル自治区出土の今より約1441年前の人骨1体[31]）
- D4i4 (D4i+G16129A!) 日本（愛知県等[31]）、韓国[31]、中国（ウイグル族1人[31]、河北省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4i5 (D4i+T16356C)
- D4i5a (D4i5+T9725C+C12432T) 中国[30]
- D4j モンゴル（ホブド県出土の今より約3065年前の人骨I7039[31]）、韓国[30]、日本[30]（北海道・東北・中部北陸等・計1.0%[4]、千葉県[31]）、中国（漢族 1.952%[16]、ウイグル族・鳳城市漢族[31]、新疆ウイグル自治区出土の今より約2514年前の人骨JEZKL_M25-2[31]）、台湾[30]
- D4j1 (D4j+G5262A)
- D4j+G12501A トルコ[30]
- D4j3'11'23'28 (D4j+T16311C!)
- D4j3 (D4j+T16311C!+C16184T) 中国（漢族 0.485%[16]）、日本（中部北陸地方等・計0.3%[4]）
- D4j3a (D4j3+G1709A) 日本（中部北陸地方等・計0.3%[4]）、ロシア[30]（ウリチ[31]）、中国[30]（内モンゴル自治区ブリヤート族・黒竜江省ダウール族・山東省・新疆ウイグル自治区出土の今より約2514年前の人骨NLKDML_M50A[31]）
- D4j3b (D4j3+C338T) 中国（チベット自治区ローバ族・新疆ウイグル自治区ウイグル族・今より約870年前のチベット自治区Longsangquduo遺跡出土の人骨OQ707127.1ことLongsangquduo_10[31]、漢族 陝西省1人・遼寧省1人・山西省1人・河南省1人・四川省1人・計0.023%[16]）
- D4j3c (D4j3+G9055A) 日本[30]、中国（漢族 0.102%[16]、ウイグル族[31]）
- D4j3d (D4j3+T15300C) 中国[31]（漢族 0.129%[16]）
- D4j3e (D4j3+T3753C) 日本[31]、中国（江蘇省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4j3e1 (D4j3e+A7158G) 中国（上海市等[31]）
- D4j3f (D4j3+T6488C) 韓国[30]、日本[30]
- D4j3g (D4j3+T2226C+G15928A) 中国（江蘇省漢族2人・浙江省漢族1人・計0.014%[16]）
- D4j3g1 (D4j3g+G3391A+T10003C) ロシア[30]
- D4j11'28 (D4j+T16311C!+G12630A)
- D4j23 (D4j+T16311C!+A16171G) ウクライナ[30]
- D4j3 (D4j+T16311C!+C16184T) 中国（漢族 0.485%[16]）、日本（中部北陸地方等・計0.3%[4]）
- D4j4 (D4j+T10245C) ロシア[30]（ガナサン人[31]）、中国（甘粛省漢族1人・計0.0046%[16]）
- D4j5 (D4j+A14128G) イラン[30]、チェコ[30]、オーストリア[30]、ドイツ[30]
- D4j6'13 (D4j+T146C!) 日本（中部北陸地方・計0.1%[4]）
- D4j6 (D4j+T146C!+G7805A)
- D4j13 (D4j+T146C!+T485C+G4655A+T5075C)
- D4j7 (D4j+A9578G+T13753C)
- D4j8 (D4j+C16174T)
- D4j9 (D4j+C13573A)
- D4j10 (D4j+T14488C)
- D4j12 (D4j+A7353G+C8273T+T15470C)
- D4j14 (D4j+T16231C) 日本（東北・近畿・計0.1%[4]、愛知県等[31]）
- D4j15 (D4j+C15529A)
- D4j16 (D4j+A6752G+G12771A) 日本（九州地方・計0.1%[4]）、中国[31]（漢族 0.060%[16]）
- D4j17 (D4j+A16299G) 日本[30]（愛知県[31]）
- D4j17a (D4j17+C9335T)
- D4j17a1 (D4j17a+T3866C) 中国[31]
- D4j17a (D4j17+C9335T)
- D4j18 (D4j+G4048A) 日本（東京都[31]）、中国（漢族 0.037%[16]）
- D4j18a (D4j18+C11509T) 中国（ウイグル族[31]）
- D4j19 (D4j+T13020C)
- D4j20 (D4j+T16288C)
- D4j21 (D4j+T10649C)
- D4j22 (D4j+T10915C!)
- D4j24 (D4j+T16093C)
- D4j25 (D4j+T8277C)
- D4j26 (D4j+A16293G)
- D4j27 (D4j+C13071A)
- D4k 日本（東京都[31]、0.1%・中部北陸地方[4]）、韓国[31]、中国（陝西省漢族1人・安徽省漢族1人・広東省漢族1人・浙江省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.023%[16]、ウイグル族1人[31]）、キルギス[31]
- D4l 日本（0.3%・中部北陸地方等[4]）
- D4m
- D4m1 日本[30]（東京都等[31]、0.5%・東北地方・関東甲信越地方・中部北陸地方[4]）、アメリカ合衆国[31]、中国（河北省漢族1人・浙江省漢族1人・計0.009%[16]）
- D4m2 カザフスタン[31]、キルギス[31]、中国（キルギス族・ウイグル族[31]）
- D4m2+A1222G カザフスタン（今より約700年前の人骨1体[31]）
- D4m2a (D4m2+A1222G+C16214T) ロシア（ニヴフ[31]）、中国（黒竜江省ダウール族[31]）、日本（0.1%・中部北陸地方[4]）
- D4m2a1 ロシア（エヴェンキ[31]）、中国（漢族 0.088%[16]）
- D4m2a1a ロシア（エヴェン・ユカギール[31]）
- D4m2a2 (D4m2a+C194T) ロシア（チェルカン・Tuba[31]）
- D4m2a3 (D4m2a+C13881T) ロシア（ニヴフ[31]）
- D4m2a4 (D4m2a+C16192A) ロシア（ヤクート[31]）
- D4m2a5 (D4m2a+A15847G) ロシア（ニヴフ[31]）
- D4m2a6 (D4m2a+A7430G) ハンガリー（今より約950年前の人骨1体[31]）
- D4m2a6a (D4m2a6+C4676T) ロシア（ハムニガン・ブリヤート[31]）
- D4m2a1 ロシア（エヴェンキ[31]）、中国（漢族 0.088%[16]）
- D4m2+A1222G+T8868C 中国（ウイグル族・バルガ族・黒竜江省ダウール族[31]）、ロシア（Tuvinian[31]）
- D4m2a (D4m2+A1222G+C16214T) ロシア（ニヴフ[31]）、中国（黒竜江省ダウール族[31]）、日本（0.1%・中部北陸地方[4]）
- D4m2+A1222G カザフスタン（今より約700年前の人骨1体[31]）
- D4n 日本[30]（0.8%・北海道地方・東北地方・中部北陸地方・近畿地方・九州地方[4]）、韓国[30]、中国（漢族 0.143%[16]）
- D4o
- D4o1 ロシア（ハムニガン[31]）、中国（漢族 0.069%[16]）
- D4o2 中国（バルガ族・黒竜江省ダウール族[31]、漢族 0.051%[16]）
- D4o2a ロシア（ガナサン[31]）、キルギス[31]、中国（エヴェンキ族・ウイグル族[31]）
- D4o2a1 中国（ウイグル族・赫哲族等[31]）、ロシア（ネギダール[31]）
- D4o2a2 (D4o2a+C8897T) ロシア（ヤクート[31]、サハ共和国出土の今より約766年前の人骨1体Yana_Young[31]）
- D4o2a3 (D4o2a+G6260A) ロシア（ブリヤート[31]）、中国（バルガ族[31]）
- D4o2a4 (D4o2a+G930C) ロシア（カムチャツカ地方エヴェン・コリャーク[31]）
- D4o2a5 (D4o2a+C3789T) ロシア（ヤクート[31]）、中国（ウイグル族[31]）
- D4o2a6 (D4o2a+C15891T)
- D4o2a7 (D4o2a+C16184T) 中国（黒竜江省ダウール族[31]）
- D4o2a8 (D4o2a+C8922T) ロシア（マガダン州エヴェン[31]）
- D4o2a ロシア（ガナサン[31]）、キルギス[31]、中国（エヴェンキ族・ウイグル族[31]）
- D4o3 (D4o+G9196A) ロシア（テレウト・ブリヤート[31]）、中国（ウイグル族[31]）
- D4p モンゴル[31]、ロシア（トジャ・アルタイ・ブリヤート[31]）
- D4q ネパール[31]
- D4q+C16256T インド（ジャンムーカシミール州[31]）、キルギス[31]、中国（山東省[31]、新疆ウイグル自治区出土の今より約870年前の人骨1体[31]）、台湾[30]
- D4q1 (D4q+C16256T+T16140C) インド（トト族[31]）
- D4q+C16256T+G4959A キルギス[31]、インド（ウッタルプラデーシュ州Brahman[31]）
- D4q+C16256T+G4959A+T16356C インド（シェルドゥクペン族[31]）
- D4q+C16256T+C14827T 中国（ウイグル族[31]）
- D4q+C16256T+G5824A 中国（ローバ族[31]）
- D4q3 (D4q+C16256T+T11732C) ドイツ[30]、オランダ[30]、アメリカ合衆国[30]
- D4q4 (D4q+C16256T+A8944G+G5460A) ドイツ[30]、ポーランド[30]
- D4q+C16256T インド（ジャンムーカシミール州[31]）、キルギス[31]、中国（山東省[31]、新疆ウイグル自治区出土の今より約870年前の人骨1体[31]）、台湾[30]
- D4r (D4+C10873T) ペルー[31]
- D4s 中国（ラサ市チベット族[31]、漢族 0.060%[16]）
- D4t 中国[30]（漢族 0.120%[16]）、日本（沖縄地方・計0.1%[4]）
- D4u (D4+A8682G) 中国（新疆ウイグル自治区[31]）
- D4v (D4+C3603T)
- D4w
- D4x
- D4y
- D4z
- D5・D6 (16189): D5はD4よりも長い歴史を持ち[8][9][10]、3万7千年から3万2千年前頃に誕生したとされており[8][9][10]、D5'6 (16189) は主に東アジアと東南アジア、特に中国、韓国、日本で見られます。 D5a2a2 サブクレードが流行しているが、アメリカ大陸への移動には参加していないようであり、中央アジア、北アジア、南アジアでの頻度は一般的に低い (57/423 = 13.48%) [51] )ヤクートの中で、歴史的にモンゴル拡大の圧力の下でシベリアに移住したテュルク語を話すグループ。[37][8][9][10][11][12][13][38]。主に韓国、日本、中国南部で見られ、特に漢民族で観察頻度が高い、他は東南アジアでも見られる。英語版[39][40][41] 。中央アジア、インド東部でも低頻度で見られるが、下位系統のD5a2a2がシベリアのヤクートでよくみられる[42]。D5の有名人はAAAの西島隆弘、上田晋也、濱田龍臣、糸井重里[43]。
- D5
- D5a'b (D5+A9180G)
- D5a
- D5a1 日本[30]（岐阜県・東京都[31]、東北地方・中部北陸地方等・計1.0%[4]）
- D5a2
- D5a2a
- D5a2a3 (D5a2a+A2581G)
- D5a2a4 (D5a2a+T4500C)
- D5a2a5 (D5a2a+G3460A)
- D5a2a6 (D5a2a+T4232C)
- D5a2a+T16092C 韓国[31]、中国（福建省漢族・江西省等[31]）、日本（中部北陸地方[4]）
- D5a2a1 日本（長野県・岐阜県[31]）、韓国[31]、中国[31]、ベトナム[31]、タイ王国（ラワ族[31]）、シンガポール[31]、カザフ人[31]、トゥヴァ人[31]
- D5a2a1+C16172T!
- D5a2a1+C16172T!+A13278G
- D5a2a1+C16172T!+T12903C 中国（江西省等[31]）
- D5a2a1+C16172T!+A12753G ロシア（クマンディン・Tuba[31]）
- D5a2a1+C16172T!+G9966A 中国（湖南省漢族・四川省等[31]）
- D5a2a1+C16172T!+A1438G! ネパール[31]、中国（黒竜江省ダウール族等[31]）、韓国[31]
- D5a2a1+C16172T!+T16311C! ミャンマー[31]、中国（ミャオ族・河南省漢族等[31]）
- D5a2a1+C16172T!+A6779G 中国（福建省漢族等[31]）
- D5a2a1+C16172T!+A14280G 中国[31]
- D5a2a1+C16172T!+T16266C! 韓国[31]、インド（Gallong族[31]）
- D5a2a1b 中国（ローバ族・メンパ族・ニンティ市チベット族・湖南省漢族・マカオ等[31]）、台湾（客家[31]）、インド（Gallong族[31]）、ミャンマー（2.0%[36]）、日本（中部北陸地方・計0.1%[4]）
- D5a2a1b1
- D5a2a1b2 (D5a2a1b+G10364A)
- D5a2a1b3 (D5a2a1b+T15968C)
- D5a2a1c (D5a2a1+T11152C)
- D5a2a1d (D5a2a1+T16243C)
- D5a2a1e (D5a2a1+G9180A!)
- D5a2a1f (D5a2a1+G9182A)
- D5a2a1+C16172T!
- D5a2a2
- D5a2a1 日本（長野県・岐阜県[31]）、韓国[31]、中国[31]、ベトナム[31]、タイ王国（ラワ族[31]）、シンガポール[31]、カザフ人[31]、トゥヴァ人[31]
- D5a2a
- D5a3
- D5b
- D5b1
- D5b1a 中国（湖北省[31]）
- D5b1b 中国[30][31]（0.872%[16]）、日本[30]（東京都等[31]、東北地方・中部北陸地方・近畿地方等・計0.6%[4]）、カザフスタン[31]
- D5b1b1 日本[30]（東京都・愛知県等[31]、沖縄地方・東北地方・関東甲信越地方・中部北陸地方・計0.2%[4]）、韓国[31]、中国（漢族重慶市1人・陝西省1人・北京市1人・計0.014%[16]）、ウズベク人[31]
- D5b1b2 中国（漢族 0.365%[16]）、韓国[31]、日本[30]（東京都[31]、東北地方・中部北陸地方・計0.2%[4]）
- D5b1b3 (D5b1b+C14082T) 日本（東京都等[31]）、韓国[31]
- D5b1b4 (D5b1b+T8793C) 中国[31]
- D5b1b5 (D5b1b+T14319C) 韓国[31]
- D5b1b6 (D5b1b+T9813d)
- D5b1b7 (D5b1b+A2356G) 中国（福建省漢族[31]）
- D5b1b8 (D5b1b+A3399G)
- D5b1c
- D5b1c1 中国（漢族 0.277%[16]）
- D5b1c2 (D5b1c+C15400T)
- D5b1c2a (D5b1c2+C11497T) 中国（ウイグル族[31]）
- D5b1c3 (D5b1c+C3510T) 中国（昆明市漢族[31]）
- D5b1d 中国[30][31]（漢族 0.083%[16]）
- D5b2 日本[30]（東京都・愛知県[31]、中部北陸地方・計0.1%[4]）
- D5b3 中国（漢族 0.254%[16]）
- D5b4 タイ王国[31]、中国（漢族 0.106%[16]）
- D5b5 (D5b+C12224T) 中国（ウイグル族[31]）
- D5b1
- D5a
- D5c
- D5a'b (D5+A9180G)
- D6
- D6a
- D6c
- D5
- D4 (3010, 8414, 14668): 日本人で最も多いグループであり[8][9][10][11][12][13]、北東アジアでよくみられ、日本人、朝鮮民族などでは最も高頻度で観察されるタイプであり、とりわけ日本人に於いてその頻度が高い。[7][6][17][18][19][5][20] ウィルタ、ブリヤート、カルムイク人、テレンギト人などでも最もよく見られるタイプである[17][21]。中国・中国西部・中央アジア、アメリカ先住民で広く観察される[22][23][24][25][26][27][28]。パレオ・インディアンやロシア沿海州（悪魔の門）及び中国東北部の新石器時代初期の遺跡（吉林省大安市にあるホウタオムガ遺跡、内モンゴル自治区通遼市にあるハミンマンハ遺跡等）でも最も頻繁に見られるハプログループである。
| ミトコンドリア・イブ (L) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1 | L5 | L2 | L6 | L4 | L3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M7 | M8 | M9 | D | G | Q | N1 | N2 | N9 | A | O | S | X | R | ||||||||||||||||||||||||||
| M7a | C | Z | E | I | W | Y | R0 | R9 | B | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||||
| HV | F | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
脚注
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