北海道高速鉄道開発

石勝線・根室本線高速化事業

釧路市からの要望を受け、1993年に幹線鉄道等活性化事業として、釧路 - 札幌間の高速化事業が国（運輸省）から認定された。この事業の事業主体として、1994年1月、北海道、釧路市と一部沿線自治体と北海道旅客鉄道（JR北海道）が出資した第三セクター「道東高速鉄道開発株式会社」（本社　札幌市）を設立し^[4]、石勝線南千歳駅 - 上落合信号場間および根室本線上落合信号場 - 釧路駅間（上落合 - 新得間は石勝線との重複区間）の高速化工事を行った。これが北海道高速鉄道開発の前身である。なお、地上設備は道東高速鉄道開発がJR北海道に貸し付けるという形式をとっている。ただし、第三種鉄道事業者ではない。

工事施工後の1997年3月22日、キハ283系による特急「スーパーおおぞら」がデビューした。2000年3月11日には、「スーパーとかち」に使用する車両もキハ283系に改められた。

宗谷本線高速化事業

宗谷本線は1997年に、旭川 - 名寄間が、幹線鉄道等活性化事業として国（運輸省）から認定され、高速化事業に着手した。同年9月16日、出資者に士別市と名寄市を加えた上で、道東高速鉄道開発を現在の北海道高速鉄道開発に改組した^[5]。北海道高速鉄道開発が地上設備改良工事を実施し、その設備をJR北海道に貸し付ける形式は前述の根室本線高速化事業と同じだが、当該区間の需要がかなり少ないため、高速化と同時に投入するキハ261系も保有し、JR北海道に貸し付けることにした。

2000年3月11日に特急「スーパー宗谷」がデビューしている。

キハ261系を投入したスーパー宗谷はデビュー後の盛況で3編成がフル稼働となり、予備車なしという状況が続いた。その為、JR北海道が独自に2両を増備している。しかし、石北本線も含めた183系の老朽化や車両運用の都合^[6][7][8][9]から、2017年3月4日以降はダイヤ改正により、一部の特急列車が旭川止まりになり、「宗谷」（札幌 - 稚内直通）「サロベツ」（旭川 - 稚内間のみ）となる^[10]。

札沼線（学園都市線）電化事業

札幌圏唯一の非電化区間である札沼線（学園都市線）のうち、沿線の発展が著しく利用者が増加基調であった桑園 - 北海道医療大学について、サービスのレベルアップ、環境負荷の軽減、経営の効率化^[11][12]を目的とした交流電化が、幹線鉄道等活性化事業として国（国土交通省）から認定され、工事が同社により2009年度から2011年度にかけて行われ、2012年6月1日に電化開業した。なお、工事に当たっては国・自治体からそれぞれ補助対象事業費の20%の補助金等を受け、完成後の設備についても北海道高速鉄道開発が保有し、JR北海道に有償貸し付けを行っている^[11]。

観光列車等導入支援事業

JR北海道が保有する「リゾート車両」などの老朽化に伴い北海道と国（鉄道・運輸機構）が共同で行う「鉄道車両の快適性・利便性の向上を図る観光列車等の導入への支援」事業において、キハ261系5000番台「ラベンダー」編成やH100形観光列車兼用車両を車両メーカーより買い上げて保有し、JR北海道に無償貸し付けを行っている（なお、車両の維持管理費はJR北海道が負担する^[13]）。車両の買い上げにかかる費用は、北海道と国が折半して負担している^[14][15]。なお、当社保有の車両に係るJR北海道のプレスリリースには次のような謝辞が記される。

「ラベンダー」編成は、北海道と国の支援を受け、北海道高速鉄道開発株式会社が所有し、当社は無償貸与を受けております。支援に感謝を申し上げます。 — JR北海道ニュースリリース、2024年1月19日^[16]

当該車両は、１両あたり約2.8億円（計約11.4億円）で北海道高速鉄道開発株式会社（道高速）に取得していただき、当社が無償貸与を受けます。支援に感謝申し上げます。 — JR北海道ニュースリリース、2024年1月17日^[17]