久松俊勝の次男として尾張国阿古居城(現在の愛知県知多郡阿久比町)にて誕生。
永禄3年(1560年)3月、異父兄・家康と会見して康元と改名し、それに伴い松平姓を下賜(かし)されたという(『寛政譜』他)。永禄5年(1562年)上ノ郷城主となる。天正18年(1590年)落城後の小田原城の守備にあたり、同年下総国関宿藩2万石の所領を与えられ、天正19年(1591年)には4万石に加増された。慶長5年(1600年)の関ヶ原の戦いでは、家康の代理として江戸城の留守居役を務めている。
慶長8年(1603年)に死去した。享年52。嫡男の忠良が家督を継いだ。