那加バイパス開通当初は平面交差点（東中島交差点）であったが、2000年（平成12年）、岐大バイパスと那加バイパスを高架で接続させる区間（三宅立体区間）の暫定供用(この時は左車線がそのまま側道に、右車線が岐大バイパス本線であった)及び、2002年（平成14年）、三宅立体4車線開通により開設される。
ハーフインターチェンジであり、国道21号からは下り線から出ることしか出来ない。また、接続する道路からは国道21号線上り線にしか入れない。
長森南インターチェンジは、各務原市川島地区（旧川島町）方面へ接続するインターチェンジの役割もあり、案内板には、河川環境楽園の表示がされている。
