旧本庁舎は、2007年に総務省から郵政事業庁が分離民営化される際に日本郵政グループ松山ビルとして移管され間借りの状態となったうえに、同ビルは老朽化が問題となっていた。また別館についても、前面道路が愛媛県と松山市が整備を行う予定のJR松山駅駅前整備に係る道路用地として拡幅される予定であるため、将来的には立ち退きをする必要がある。四国総合通信局はこの別館の立ち退きを受け、老朽化している本庁も含めた移転を計画[1]。移転先については具体的には決定していないものの、松山市外へ移転する可能性もあることから、松山市議会や愛媛県議会では国に対し松山市外への移転をさせないよう2010年9月27日と10月8日にそれぞれ意見書を提出している[2][3]。要旨としては「総合通信局の松山市外移転は松山市の情報通信分野や地域経済に甚大な影響を及ぼす他、地元への定着もあることから是非とも松山市外へは移転しないように要望する」というものである。
これら市外への移転を食い止めようとする愛媛県や松山市に対し、移転先としての受け入れに積極的なのが香川県高松市である。高松市議会でも議題に挙がっており、当時建設中だった高松サンポート合同庁舎への誘致が有力視されていた[4]。高松市には四国管区における国の出先機関（地方支分部局）15局中、総合通信局と森林管理局を除く13局が所在しており、香川県と高松市はそれら出先機関を一ヶ所に集約した高松サンポート合同庁舎を建設中で、2006年（平成18年）11月には先行してA棟が完成し翌月12月に運用を開始した。残るB棟についても2007年度予算案に設計費が盛り込まれたが、政権交代により2010年度からは予算が凍結されている。しかし、香川県と高松市はこのB棟建設に意欲的であり、松山市・愛媛県意見書提出直後の2010年11月18日には国会議員に対しB棟の早期着工を要望していた[5]。
しかし、四国総合通信局は2015年4月10日、「庁舎移転に伴う新庁舎の設計」として、現庁舎近くに庁舎移転のため平成27年度に新庁舎の設計を行うことを発表し、これにより国立印刷局松山倉庫跡地（松山市味酒町二丁目14番地4）への移転が決定した[6][7]。2016年度に着工し、2017年度末の完成を予定している。
2018年11月26日、新庁舎での業務開始[8][9]。
