Aconitase
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| Aconitase | ||
 Structure d'une aconitase bovine (PDB 1AMI[1]) | ||
| Caractéristiques générales | ||
|---|---|---|
| Nom approuvé | Aconitase 1 | |
| Symbole | ACO1 | |
| N° EC | 4.2.1.3 | |
| Homo sapiens | ||
| Locus | 9p21.1 | |
| Masse moléculaire | 98 399 Da[2] | |
| Nombre de résidus | 889 acides aminés[2] | |
| Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
| Aconitase mitochondriale | ||
| Caractéristiques générales | ||
| Nom approuvé | Aconitase 2 | |
| Symbole | ACO2 | |
| N° EC | 4.2.1.3 | |
| Homo sapiens | ||
| Locus | 22q13.2 | |
| Masse moléculaire | 85 425 Da[2] | |
| Nombre de résidus | 780 acides aminés[2] | |
| Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
| N° EC | EC |
|---|---|
| N° CAS | |
| Cofacteur(s) | Fe-S |
| IUBMB | Entrée IUBMB |
|---|---|
| IntEnz | Vue IntEnz |
| BRENDA | Entrée BRENDA |
| KEGG | Entrée KEGG |
| MetaCyc | Voie métabolique |
| PRIAM | Profil |
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| GO | AmiGO / EGO |
L’aconitase (ou aconitate hydratase ou ACO), est une Isomerase qui catalyse la réaction :
 |
H2O + |  |
 | |
| Citrate | cis-Aconitate | Isocitrate |
Cette enzyme intervient notamment dans le cycle de Krebs pour réaliser l'isomérisation stéréospécifique du citrate en isocitrate via le cis-aconitate[3],[4],[5]. La réaction d'isomérisation implique une déshydratation suivie d'une réhydratation afin de translater l'atome d'oxygène de l'hydroxyle de part et d'autre d'une liaison double transitoire.
Contrairement à la plupart des protéines fer-soufre, qui fonctionnent comme transporteurs d'électrons, le centre fer-soufre de l'aconitase réagit directement avec le substrat de l'enzyme.
L'aconitase présente deux configurations légèrement différentes selon qu'elles activée ou inactivée[6],[7].
La forme inactive contient quatre domaines[6]. Seuls les trois premiers domaines à partir de l'extrémité N-terminale interagissent étroitement avec les centre [3Fe-4S], mais le site actif fait intervenir des résidus des quatre domaines, y compris le grand domaine C-terminal. Le centre Fe-S et un anion SO42− se logent également dans le site actif[6].
Lorsque l'enzyme est activée, elle acquiert un atome de fer supplémentaire pour former un centre [4Fe-4S][7],[8], tandis que la structure du reste de l'enzyme demeure quasiment inchangée, avec une translation des autres atomes n'excédant pas 10 pm[7].
Régulation
L'aconitase a un centre actif [Fe4S4]2+ qui peut se convertir en une forme inactive [Fe3S4]+. Trois résidus de cystéine ont été identifiés comme ligands du centre [Fe4S4]. Dans la forme active de ce cluster, le cation de fer labile est coordonné à des molécules d'eau et non à des résidus de cystéine de l'enzyme.
L'aconitase est inhibée par l'anion fluoroacétate FCH2COO−, présent notamment dans le fluoroacétate de sodium FCH2COONa, qui agit donc comme un poison. Le centre fer-soufre est très sensible à l'oxydation par les anions superoxyde O2−[9].
Dénominations alternatives
- cis-Aconitase.
- Citrate-hydrolyase.
- Citrate(isocitrate)-hydrolyase.
- Protéine régulatrice du fer ou IRP1 (pour ACO1)
