古くはこの付近一帯を寺島と呼び、鎌倉時代からの史料に見られる。新町川と寺島川（現在のJR沿いにあった廃河川）に囲まれた中洲が寺島である。その中心は中町（現 八百屋町2丁目付近）と呼ばれた。
江戸時代初頭、徳島城下町建設時に、勝瑞や蜂須賀氏旧領の尾張から諸寺が集められた。諸寺は元和・寛永期に眉山山麓の寺町に移され、寺島には武家町が生まれた。当時、現在の寺島本町は寺島本丁と書いた。
明治になると、寺島北部の武家町が寺島町と呼ばれるようになった（寺島南部には町人町もあった）。1888年、市制施行された徳島市の町名として寺島町が置かれ、
- 寺島本町北 - 現 寺島本町西・寺島本町東。
- 寺島本町南 - 現 寺島本町東の南部。
- 稲田屋敷跡 - 現 幸町1丁目。
- 賀島屋敷跡 - 現 幸町2丁目（市役所周辺）。
- 船場町東 - 現 寺島本町西1丁目から藍場町1丁目にかけての境界付近（アミコビル西部周辺）。東船場町とは異なる。
- 藍場町
の6字からなった（現在の地名との対応はおおよそ）。寺島本町北・南がほぼ現在の寺島本町西・東にあたる。
1941年、寺島本町西 (1～3、現在は1～2)・寺島本町東 (1～3)・元町 (1～2)・藍場町 (1～3、現在は1～2)・幸町 (1～2、3は除く) に分割された。