宝暦4年（1754年）3月23日、第4代藩主・京極高矩の長男（次男との説もある）として江戸で生まれる。宝暦13年（1763年）に父が死去したため、家督を継ぐ。明和7年（1770年）12月16日に従五位下・能登守に叙位・任官する。
安永9年（1780年）、勘定奉行の村井忠左衛門を登用して銀札を発行した。さらに備蓄米の法を制定し、窮民救済に努めた。また、儒者である渡辺半八を登用し、学問所である正明館を拡大して学問を奨励し、福島甚浦を建設して船舶の利便を図った。文化3年（1806年）に若狭守に遷任する。文化8年（1811年）1月13日に江戸屋敷で死去した。享年58。跡を四男の高朗が継いだ。
