静岡県榛原町（現・牧之原市静谷）生まれ。学校組合立牧之原中学校卒業。1975年（昭和50年）3月、静岡県立島田商業高等学校卒業。同年4月、榛原町役場に奉職[2]。
2007年（平成19年）牧之原市都市整備課長、2009年（平成21年）4月、牧之原市秘書広報課長、2012年（平成24年）4月、牧之原市総務部長。
2013年（平成25年）12月、牧之原市副市長に就任。
2017年（平成29年）7月31日、市役所榛原庁舎で記者会見し、任期満了に伴う牧之原市長選挙に立候補する意向を表明。会見には西原茂樹市長も同席し、杉本は「後継指名を打診され、挑戦を決意した」と説明した[3]。8月に副市長を辞職。
第48回衆議院議員総選挙と同日に行われた市長選（2017年10月22日）において、元市議の大石健司、元旧相良町議の名波力ら2候補を退け初当選を果たした[4]。10月30日、市長就任。選挙の結果は以下のとおり[5]。
※当日有権者数：37,984人 最終投票率：66.59%（前回比：＋4.3pts）
| 候補者名 | 年齢 | 所属党派 | 新旧別 | 得票数 | 得票率 | 推薦・支持 |
|---|
| 杉本基久雄 | 60 | 無所属 | 新 | 11,987票 | 48.50% | （推薦）連合静岡 |
| 大石健司 | 52 | 無所属 | 新 | 7,198票 | 29.12% | |
| 名波力 | 71 | 無所属 | 新 | 5,532票 | 22.38% | |
2021年、無投票で再選。
2025年10月26日、3選[6][7]。
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