別海駐屯地

第5偵察隊長が別海駐屯地司令を兼務する。最寄の演習場は、矢臼別演習場で別海駐屯地業務隊矢臼別演習場管理班が管理する。

内陸部隊では唯一僻地手当が支給される部隊である^[要出典]。航空自衛隊の計根別飛行場と一体化しており、滑走路を共同使用している。

「重要施設の周辺地域の上空における小型無人機等の飛行の禁止に関する法律」による対象防衛関係施設に指定されている。

特地勤務手当

2026年4月1日より、防衛省の職員の給与等に関する法律施行令により、別海駐屯地に所在する陸上自衛隊の部隊又は機関（自衛隊法施行令第五十条第一項ただし書に規定する部隊又は機関を除く）に属する自衛官は俸給の7%、事務官等及び特定任期付職員である自衛官は俸給の8%を特地勤務手当（2級）として支給される予定^[1][2]。

日本陸軍

• 1944年（昭和19年）3月 - 日本陸軍航空隊計根別第四飛行場が設置

農林省（当時）

• 終戦に伴い､広野の第四飛行場は農林省（当時）に所管換えされ､開拓財産として一部が農民に開放されたことから10戸が入植した

アメリカ空軍

• 1952年（昭和27年）6月 ～ 12月 - 第四飛行場地区に米軍が進駐し、駐留軍施設隊が滑走路･誘導路の補修を開始

航空自衛隊計根別基地

• 1957年（昭和32年）2月 - 米空軍撤退し、自衛隊へ移管。これに伴い 航空自衛隊計根別基地が開設される
• 時期不明 - 航空自衛隊も滑走路部分を残して基地を閉鎖する

陸上自衛隊

• 1963年（昭和38年）3月 - 陸上自衛隊別海駐屯部隊の配置を決定

陸上自衛隊釧路駐屯地別海分屯地

• 1965年（昭和40年）3月15日 - 釧路駐屯地別海分屯地として開設^[3]

1. 第27普通科連隊第3普通科中隊が釧路駐屯地から移駐。第3普通科中隊長が分屯地司令を兼務^[4]
2. 第5偵察隊が鹿追駐屯地から移駐

陸上自衛隊別海駐屯地

• 1966年（昭和41年）2月21日 - 別海駐屯地に昇格^[5]。第27普通科連隊第3普通科中隊長が駐屯地司令を兼務^[4]

1. 北部方面隊隷下の第424会計隊を配置
2. 調査隊別海派遣隊を配置

• 1968年（昭和43年）3月 - 第399基地通信隊を設置
• 1974年（昭和49年）8月 - 別海駐屯地業務隊を設置
• 1975年（昭和50年）3月26日 - 第399基地通信隊が第302基地通信中隊別海派遣隊に改編
• 1987年（昭和62年）3月17日 - 別海駐屯地司令職務を第27普通科連隊第3普通科中隊長から第5偵察隊長に移管
• 2015年（平成27年）
  • 3月25日 - 会計隊の改編に伴い、第424会計隊が廃止
  • 3月26日 - 第377会計隊別海派遣隊を設置

• 第5旅団
  • 第5偵察隊
  • 第27普通科連隊（一部）
    • 第3普通科中隊
  • 第5後方支援隊
    • 第2整備中隊（一部）
      • 偵察直接支援小隊：第5偵察隊を支援
      • 第3普通科直接支援小隊
        • 別海整備班：第27普通科連隊第3普通科中隊を支援
• 北部方面システム通信群
  • 第101基地システム通信大隊
    • 第302基地通信中隊（一部）
      • 別海派遣隊
• 北部方面会計隊
  • 第377会計隊（一部）
    • 別海派遣隊
• 別海駐屯地業務隊

• 警務隊
  • 北部方面警務隊
    • 第121地区警務隊
      • 別海連絡班

• 一般道：国道243号、国道272号、北海道道13号中標津標茶線、北海道道928号上風連中西別線
• 鉄道：JR北海道釧網本線 標茶駅、摩周駅
• 港湾：標津港（地方港湾）
• 飛行場：中標津空港（第三種空港）