熊本駐屯地

自衛隊熊本病院長が駐屯地司令を兼務する。本駐屯地には会計隊および駐屯地業務隊が編成されず、自衛隊熊本病院がそれらの業務を行う。最寄の演習場は、大矢野原演習場と黒石原演習場。

警察予備隊熊本駐屯地

• 1950年（昭和25年）11月16日：警察予備隊熊本営舎開設^[1]。

• 1951年（昭和26年）5月1日：第4管区隊第12連隊編成により、第3大隊が熊本駐屯地に配置。第3大隊長が駐屯地部隊長を兼務。
• 1952年（昭和27年）1月19日：第12連隊第3大隊が第10連隊第2大隊に改称。

保安隊熊本駐屯地

• 1952年（昭和27年）10月15日：保安隊発足。

陸上自衛隊熊本駐屯地

• 1954年（昭和29年）
  • 7月1日：陸上自衛隊へ移管され熊本駐屯地となる^[2]。
  • 8月10日：第16普通科連隊編成により、第2大隊が熊本駐屯地に配置。
  • 8月17日：第10普通科連隊第2大隊の東千歳駐屯地への移駐により、第16普通科連隊第2大隊長が駐屯地司令職に指定^[3]。
  • 10月5日：第4特車大隊が編成。
  • 11月15日：第4特車大隊が健軍駐屯地に移駐。
• 1955年（昭和30年）12月1日：第8混成団編成により、第8混成団本部が置かれ^[1]、副団長が駐屯地司令職に指定^[4]。
• 1956年（昭和31年）1月26日：第16普通科連隊第2大隊が大村駐屯地へ移駐。
• 1957年（昭和32年）
  • 3月15日：第8混成団本部が北熊本駐屯地へ移駐を開始^[1]。
  • 4月5日：第8混成団本部が北熊本駐屯地へ移駐^[1]。
  • 8月1日：陸上自衛隊熊本地区病院が開設^[5]。
• 1988年（昭和63年）4月8日：陸上自衛隊熊本地区病院が自衛隊熊本病院に改称^[6]。
• 2009年（平成21年）4月：三宿駐屯地に続き2例目となる民間運営の託児所が開設^[7]。

• 自衛隊熊本病院（共同機関、陸上幕僚長を通じて指揮監督を受ける。）

• 西部方面システム通信群
  • 第102基地システム通信大隊
    • 第302基地システム通信中隊（一部）
      • 熊本派遣隊