1999年のJリーグ ディビジョン2

Jリーグが2ディビジョン制になって初めてのシーズンである。参加クラブの大半はジャパンフットボールリーグ（旧JFL）参戦組で、早くからJリーグ入りを目指した準会員組のみならず、エクスパンションを機にJリーグ参入を目指して実業団やクラブチームから衣替えしたクラブが数多く参加し、J1への切符を賭けて戦った。

初年度のJ2参加クラブは10クラブ。この内コンサドーレ札幌と川崎フロンターレは前年のJ1参入決定戦の結果J2入りが決まったクラブで、札幌は唯一の「前年のJリーグからのJ2参戦クラブ」である。川崎Fを含む9クラブは前年の旧JFLに参戦していたクラブで、準会員は川崎Fとベガルタ仙台の2クラブのみ。他の7クラブは（準会員だった鳥栖フューチャーズの事実上の受け皿となったサガン鳥栖を含め）準会員資格を取得せずに直接Jリーグ参入を果たしたクラブである。

なお、FC東京と大分は、将来的にホームスタジアムとする予定であった東京スタジアムと大分スポーツ公園総合競技場がそれぞれ建設中だったこともあり、共にホームスタジアムを暫定的な本拠地としている。

チーム名	監督	所在 都道府県	ホームスタジアム	前年度成績	備考
コンサドーレ札幌	岡田武史	北海道	札幌厚別公園競技場	Jリーグ14位	参入決定戦の結果により降格。
ベガルタ仙台	鈴木武一	宮城県	仙台スタジアム	旧JFL7位	ブランメル仙台から改称。
モンテディオ山形	植木繁晴	山形県	山形県総合運動公園陸上競技場	旧JFL3位
大宮アルディージャ	ピム・ファーベーク	埼玉県	埼玉県営大宮公園サッカー場	旧JFL12位
FC東京	大熊清	東京都	国立西が丘サッカー場 駒沢オリンピック公園総合運動場陸上競技場 江戸川区陸上競技場	旧JFL1位	ホームスタジアムは暫定。
川崎フロンターレ	ベット	神奈川県	等々力陸上競技場	旧JFL2位
ヴァンフォーレ甲府	勝俣進	山梨県	山梨県小瀬スポーツ公園陸上競技場	旧JFL4位
アルビレックス新潟	永井良和	新潟県	新潟市陸上競技場	旧JFL11位
サガン鳥栖	楚輪博	佐賀県	鳥栖スタジアム	旧JFL8位
大分トリニータ	石崎信弘	大分県	大分市営陸上競技場	旧JFL6位	大分FC（大分トリニティー）から改称。 ホームスタジアムは暫定。

当時2ステージ制を取っていたJ1と異なり、年間4回戦総当り（ホーム・アンド・アウェー2試合ずつ）の1シーズン制で行われ、上位2チームがJ1自動昇格することになった。

試合の開催方式については、この年一部改正されたJ1と同一方式が採用された。90分で同点の場合は延長Vゴール方式の延長戦を行い、延長でも決着がつかない場合は引き分けとする。勝ち点は90分勝利で「3」、Vゴール勝ちで「2」、引き分けで「1」、敗戦は延長の有無に関係なく「0」として、年間の勝ち点の優劣により順位を決定する。

3月14日開幕、11月21日最終節の日程（全36節・180試合^{[注 1]}）で開催された。中断期間はなく、ほぼ毎週末に開催された。

平日のミッドウィーク一斉開催はなかったが、会場の都合等で平日開催となった試合が15試合ある。14試合はナイトゲームだったが、第25節のヴァンフォーレ甲府vsFC東京は会場の関係（照明設備のない韮崎中央公園陸上競技場で開催）もあり「平日のデーゲーム」となった（この試合の観客動員数は619人で、これは1999年シーズンでもっとも少ない観客数である）.。