恵比寿駅

JR東日本の各線（後述）が地上の高架上に、東京メトロの日比谷線が地下にそれぞれ乗り入れ、乗り継ぎ可能な接続駅となっている。また、JR東日本の駅には「EBS」のスリーレターコードが付与されている。

• JR東日本：各線（後述）
• 東京メトロ： 日比谷線 - 駅番号「H 02」

JR東日本の駅に乗り入れている路線は、線路名称上は山手線のみであるが、運転系統としては電車線を走行する環状線としての山手線電車のほか、山手貨物線を走行する埼京線と湘南新宿ラインが停車し、旅客案内ではそれぞれ別路線として扱われている。

• 山手線：電車線を走行する環状路線 - 駅番号「JY 21」
• 埼京線：山手貨物線を走行。大宮駅方面の川越線と大崎駅方面のりんかい線、東海道貨物線経由で羽沢横浜国大駅から相鉄線との相互直通運転も実施 - 駅番号「JA 09」
• 湘南新宿ライン：山手貨物線を走行する中距離電車。当駅を経由し、大宮駅方面（北行）の宇都宮線・高崎線と横浜駅方面（南行）の東海道線・横須賀線を相互直通運転 - 駅番号「JS 18」

東京メトロ日比谷線は、終着駅である北千住駅のさらに先、東武伊勢崎線（東武スカイツリーライン）を経由して日光線南栗橋駅まで相互直通運転を実施している。

また、特定都区市内制度における「東京都区内」および「東京山手線内」に属している。

• 1901年（明治34年）2月25日：日本鉄道の貨物駅として開業^[1][2]。ビール出荷専用の駅であった^[2]。
• 1906年（明治39年）
  • 4月16日：約300 m渋谷駅側に移転^[1]。
  • 10月30日：旅客営業開始^[1]。
  • 11月1日：日本鉄道が国有化、官設鉄道の駅となる^[1]。
• 1909年（明治42年）10月12日：線路名称制定により、山手線の所属となる。
• 1927年（昭和2年）3月29日：玉川電気鉄道（後に都電へ併合）の恵比寿駅前電停が開業。
• 1945年（昭和20年）5月24日：太平洋戦争中に空襲を受け、駅舎が全焼。
• 1952年（昭和27年）4月17日：鉄筋コンクリート造2階建て駅舎が落成^{[新聞 1]}。
• 1964年（昭和39年）3月25日：帝都高速度交通営団（営団地下鉄）日比谷線の駅が開業^[3]。
• 1967年（昭和42年）12月9日：都電恵比寿駅前電停が廃止。
• 1974年（昭和49年）7月1日：営団地下鉄日比谷線の駅に自動改札機を設置。
• 1982年（昭和57年）11月15日：国鉄恵比寿駅の貨物取り扱いを廃止^[1]。同時にサッポロビール東京工場専用線も廃止。
• 1986年（昭和61年）
  • 4月2日：横須賀線臨時列車の一部の当駅への乗り入れ開始に伴いホームを1面増設、新宿駅 - 逗子駅間運転開始。
  • 11月1日：カートレインの発着駅が汐留駅から変更される^[1]。
• 1987年（昭和62年）4月1日：国鉄分割民営化に伴い、国鉄の駅は東日本旅客鉄道（JR東日本）の駅（山手線所属）となる。
• 1990年（平成2年）
  • 11月17日：JR東日本の東口に自動改札機を設置^[4]。
  • 12月1日：JR東日本の西口に自動改札機を設置^[4]。
  • 12月21日：カートレインの発着駅が浜松町駅に変更される^[1]。
• 1996年（平成8年）3月16日：埼京線運転区間が当駅まで延長^{[新聞 2][新聞 3]}。ただし当駅でそのまま折り返すことが出来なかったため、4番線到着の列車は大崎駅構内（当時はホーム未設置）まで行き、そこで折り返すという形態だった。
• 1997年（平成9年）10月1日：駅ビル「アトレ恵比寿」が開業^[5]。
• 2001年（平成13年）
  • 11月18日：JR東日本でICカード「Suica」の利用が可能となる^{[報道 1]}。
  • 12月1日：湘南新宿ラインの運行開始。
• 2002年（平成14年）12月1日：埼京線運転区間を大崎まで延長し、同時にりんかい線と相互直通運転開始^{[報道 2]}。同時に当駅始発・終着の定期列車が消滅した。
• 2004年（平成16年）4月1日：帝都高速度交通営団（営団地下鉄）民営化に伴い、日比谷線の駅は東京地下鉄（東京メトロ）に継承される^{[報道 3]}。
• 2005年（平成17年）6月6日：サッポロビール「ヱビスビール」のテレビCMで使用されている、映画『第三の男』のテーマ曲が発車メロディとなる。1・2番線と3・4番線のパートで一つのサビ（各番線で異なるタイプ）。同曲は、2004年10月21日から12月25日までの間にも、期間限定で使用されていたが、編曲は現在のものと異なっていた。
• 2007年（平成19年）3月18日：東京地下鉄でICカード「PASMO」の利用が可能となる^{[報道 4]}。
• 2008年（平成20年）2月25日：カラー電子ペーパーを使用した広告実験を開始。
• 2010年（平成22年）6月26日：山手線ホームで、JRグループの在来線としては史上初となる可動式ホームドアの使用を開始^{[報道 5]}。
• 2013年（平成25年）11月15日・11月22日：駅ビル「アトレ恵比寿」の3階がリニューアル^{[報道 6]}。
• 2014年（平成26年）10月：駅ビル「アトレ恵比寿」の5階がリニューアル^{[報道 7]}。
• 2016年（平成28年）4月15日：駅ビル「アトレ恵比寿西館」が開業。駅ビル「アトレ恵比寿本館」がリニューアル^{[報道 8]}。
• 2018年（平成30年）2月 - 5月：駅ビル「アトレ恵比寿」がリニューアル^{[報道 9]}。
• 2020年（令和2年）
  • 2月7日：日比谷線ホームに発車メロディを導入^[6]。
  • 6月6日：日比谷線ダイヤ改正より、THライナーが当駅終着で設定される^{[報道 10]}。
• 2021年（令和3年）2月1日：JR東日本の駅が業務委託化^[7]。
• 2023年（令和5年）
  • 1月27日：東京メトロの定期券発売所が営業を終了^[8]。
  • 8月31日：みどりの窓口の営業を終了^[9]。

ヱビスビールを製造・販売していた日本麦酒醸造会社（現在のサッポロビール）の工場が、現在恵比寿ガーデンプレイスのある場所にかつて存在していた。工場に隣接する山手線上に1901年、ビール出荷専用の貨物駅が開設された^[2]。ビールの商標に因み、駅名も「恵比寿」（当初「ゑびす」と表記）と命名される。駅開設当時の地名は「下渋谷」であった^[2]。後に、工場周辺を「ゑびす」と呼ぶようになり、1928年に駅周辺の地名も「恵比寿通」と名付けられた^[2]。駅前の恵比寿神社は、戦後に成立したものである（駅周辺の節も参照）。

商品名のヱビスと恵比寿ガーデンプレイスのローマ字表記は「YEBISU」であるが、地名と駅名の表記は「Ebisu」である。

当駅の開業後、当駅とビール工場の周辺が「恵比寿」と呼ばれるようになり、後に正式な地名になった。

• アトレ恵比寿（本館、西館） - 駅ビル
  • 恵比寿駅ビル内郵便局

東日本旅客鉄道（JR東日本）

山手線

目黒駅 (JY 22) - 恵比寿駅 (JY 21) - 渋谷駅 (JY 20)

埼京線（ 相鉄線直通含む）

■通勤快速・■快速・■各駅停車

大崎駅 (JA 08) - 恵比寿駅 (JA 09) - 渋谷駅 (JA 10)

湘南新宿ライン

■特別快速

通過

■快速・■普通

大崎駅 (JS 17) - 恵比寿駅 (JS 18) - 渋谷駅 (JS 19)

東京地下鉄（東京メトロ）

日比谷線

• □THライナー終着駅（霞ケ関駅以西は各駅に停車）

■THライナー以外の列車

中目黒駅 (H 01) - 恵比寿駅 (H 02) - 広尾駅 (H 03)