第96回天皇杯全日本サッカー選手権大会

試合	開催日	参加チーム数変動	備考
1回戦	8月27日、28日	72(2+22+1+47) → 36	2015年のJ2リーグ2位以下[† 1]、アマチュアシード、都道府県代表の参加
2回戦	9月3日、7日[† 2]	48(36+12) → 24	2015年のJ2リーグ1位以上[† 3]（シードチーム[† 4]除く）の参加
3回戦	9月22日	24 → 12
4回戦	11月9日[† 5]、12日	16(12+4) → 8	J1シードチーム[† 4]の参加
準々決勝	12月24日	8 → 4
準決勝	12月29日	4 → 2
決勝	1月1日	2 → 1

以下の「出場回数」についてはJFAの公式記録に基づくが、基本的には「前身となるチーム（クラブ化前の実業団チーム、など）からの通算回数」としている。ただし、一部に例外もある。

2016年のJ1リーグ所属の全18チーム。

チーム 出場回数 ベガルタ仙台 22年連続23回目 鹿島アントラーズ 25年連続33回目 浦和レッズ 51年連続52回目 大宮アルディージャ 21年連続22回目 柏レイソル 22年連続49回目 FC東京 23年連続23回目 川崎フロンターレ 22年連続33回目 横浜F・マリノス 38年連続39回目[備考 1] 湘南ベルマーレ 45年連続45回目

チーム 出場回数 ヴァンフォーレ甲府 21年連続25回目 アルビレックス新潟 21年連続25回目 ジュビロ磐田 37年連続40回目 名古屋グランパス 26年連続40回目 ガンバ大阪 36年連続36回目 ヴィッセル神戸 26年連続30回目 サンフレッチェ広島 45年連続65回目 アビスパ福岡 23年連続25回目 サガン鳥栖 23年連続25回目[備考 2]

2016年のJ2リーグ所属の全22チーム。

チーム 出場回数 北海道コンサドーレ札幌 35年連続36回目 モンテディオ山形 21年連続25回目 水戸ホーリーホック 21年連続21回目 ザスパクサツ群馬 14年連続14回目 ジェフユナイテッド千葉 30年連続52回目 東京ヴェルディ 41年連続42回目 FC町田ゼルビア 2年連続5回目 横浜FC 18年連続18回目 松本山雅FC 9年連続11回目 ツエーゲン金沢 10年連続13回目 清水エスパルス 25年連続25回目

チーム 出場回数 FC岐阜 11年連続11回目 京都サンガF.C. 23年連続34回目 セレッソ大阪 23年連続48回目 ファジアーノ岡山 9年連続9回目 レノファ山口FC 2年連続13回目 カマタマーレ讃岐 12年連続18回目 徳島ヴォルティス 26年連続28回目 愛媛FC 18年連続18回目 ギラヴァンツ北九州 9年連続9回目[備考 3] V・ファーレン長崎 8年連続10回目 ロアッソ熊本 17年連続17回目

第64回全日本大学サッカー選手権大会の優勝チーム。

チーム	所属リーグ	出場回数
関西学院大学	関西学生1部	5年連続25回目[備考 4]

埼玉県代表は3月20日^[8] に、徳島県代表は5月22日^[9] に、福岡・長崎・熊本の3県代表は6月26日^[10] に、島根県代表は7月3日^[11] に、広島県代表は7月10日^[12] に、香川県代表は7月30日^[13] に、山梨・高知の2県代表は7月31日^[14] に、愛媛県代表は8月7日^[15] に、佐賀・宮崎・沖縄の3県代表は8月14日^[16]、千葉・神奈川・愛知・三重・京都・山口の6府県代表は8月20日^[17]、それ以外の27都道府県代表は8月21日に^[18] それぞれ決定した。

都道府県	チーム	所属リーグ	出場回数
北海道	北海道教育大学岩見沢校	北海道学生1部	03年ぶり03回目
青森県	ヴァンラーレ八戸	JFL	05年連続06回目
岩手県	グルージャ盛岡	J3	09年連続10回目
宮城県	ソニー仙台FC	JFL	02年ぶり18回目
秋田県	ブラウブリッツ秋田	J3	15年連続23回目
山形県	山形大学	東北大学2部B	06年ぶり05回目
福島県	福島ユナイテッドFC	J3	09年連続09回目
茨城県	筑波大学	関東大学1部	02年ぶり29回目[備考 5]
栃木県	栃木ウーヴァFC	JFL	04年連続08回目
群馬県	ザスパ草津チャレンジャーズ	群馬県1部	03年ぶり02回目
埼玉県	東京国際大学	関東大学2部	02年連続04回目
千葉県	VONDS市原FC	関東1部	初出場[備考 6]
東京都	早稲田大学	関東大学1部	19年ぶり28回目[備考 7]
神奈川県	神奈川大学	関東大学2部	10年ぶり03回目
山梨県	山梨学院大学オリオンズ	山梨県SPL	04年ぶり02回目
長野県	AC長野パルセイロ	J3	05年連続06回目
新潟県	新潟医療福祉大学	北信越大学1部	初出場
富山県	カターレ富山	J3	02年ぶり08回目
石川県	北陸大学	北信越大学1部	02年連続02回目
福井県	サウルコス福井	北信越1部	05年連続08回目
静岡県	Honda FC	JFL	06年ぶり36回目
愛知県	東海学園大学	東海学生1部	初出場
三重県	鈴鹿アンリミテッドFC	東海1部	04年ぶり03回目
岐阜県	FC岐阜SECOND		02年連続08回目
滋賀県	MIOびわこ滋賀	JFL	02年連続05回目
京都府	京都産業大学	関西学生1部	02年ぶり05回目
大阪府	関西大学		03年ぶり16回目[備考 8]
兵庫県	バンディオンセ加古川	関西1部	08年ぶり07回目[備考 9]
奈良県	奈良クラブ	JFL	08年連続08回目
和歌山県	アルテリーヴォ和歌山	関西1部	08年連続08回目
鳥取県	ガイナーレ鳥取	J3	17年連続19回目
島根県	松江シティFC	中国	02年連続03回目
岡山県	ファジアーノ岡山ネクスト	JFL	06年連続06回目
広島県	SRC広島	中国	02年ぶり03回目
山口県	徳山大学	中国大学	02年ぶり08回目
香川県	アルヴェリオ高松	四国	初出場
徳島県	FC徳島セレステ		初出場
愛媛県	FC今治		08年連続08回目
高知県	高知ユナイテッドSC		初出場[備考 10]
福岡県	福岡大学	九州大学1部	06年連続31回目
佐賀県	FC.TOSU	佐賀県1部	初出場
長崎県	MD長崎	長崎県1部	初出場
熊本県	東海大学熊本	九州大学1部	02年連続02回目
大分県	大分トリニータ	J3	21年連続21回目
宮崎県	ホンダロックSC	JFL	02年ぶり12回目
鹿児島県	鹿児島ユナイテッドFC	J3	03年連続03回目[備考 11]
沖縄県	FC琉球		07年連続10回目

• 出場回数に関する備考

1回戦から3回戦の組み合わせは、2016年6月27日に発表された^[19]。また、マッチスケジュールは2016年7月7日に発表された。

ラウンド16（4回戦）の抽選は、2016年10月4日に日本サッカー協会ビル（JFAハウス）にて行われた^[20]。前回大会のラウンド16抽選と同様、ポットを2つ用いる方法で行われた。ただし、ラウンド16進出チームに決勝会場である市立吹田サッカースタジアムをホームスタジアムとするG大阪が含まれていることから、以下の方法で実施された。

1. No.73ホーム→No.73アウェー→No.74ホーム→…の順にトーナメントポジションに1から16の番号を割り当て、この番号の書かれたポット (A) を用意する。ただし、最初の段階では1から8のボールしか入っていない。
2. 3回戦勝者の12チーム+シード4チームの計16チームのうち、G大阪を除いた15チームの名前の書かれたポット (B) を用意する。
3. 最初に、ポット（A）のみを抽選し、G大阪のトーナメントポジションを決定する（これにより、G大阪は決勝進出時には必ずホーム側となる）。
4. Aのポットにトーナメントポジション9から16のボールを追加する。
5. Aのポットを抽選し、続いてBのポットを抽選して、その時点でチーム名とトーナメントポジションを紐付ける。
6. これを15回繰り返し、トーナメントの組み合わせを決定する。試合日時は、組み合わせ時点で決定となる。

ドロワーは日本サッカー協会 (JFA) 会長の田嶋幸三、スルガ銀行代表取締役会長兼CEOの岡野光喜、ゲストドロワーとして、元日本代表で天皇杯での複数回の優勝経験のある山口素弘と中田浩二^[21]。立会人にJFA常務理事／天皇杯実施委員会委員長の松崎康弘。なお、今回の抽選会の模様はテレビ中継ではなく、JFAのYouTubeチャンネル「JFATV」でのライブ配信が行われた^[21][22]。

準々決勝・準決勝のマッチスケジュールは2016年11月17日に発表された^[23]。

元日の決勝に駒を進めたのは、チャンピオンシップ・クラブW杯と続く連戦をものともせず、準決勝も序盤押し込まれる展開を耐えて横浜F・マリノスを下し^[24]、第90回大会以来6大会ぶりの決勝進出でリーグとの二冠を目指す鹿島アントラーズ^[25] と、準決勝で終始主導権を握られながら、後半40分のDF谷口彰悟のゴールで大宮アルディージャを下し、悲願のクラブ初タイトル獲得を目指す川崎フロンターレ^[26] の2チーム。両者の対戦は鹿島が勝利したチャンピオンシップ準決勝以来の顔合わせで、シーズン対戦成績は1勝1敗1分けであった。なお、リーグ1位の鹿島とリーグ3位の川崎が決勝に進出したことにより、川崎はAFCチャンピオンズリーグ2017 (ACL) 本戦の出場が決まり、リーグ4位のガンバ大阪が繰り上げでACLプレーオフ出場が決まった^[27]。

試合序盤はMFエドゥアルド・ネットを累積警告で欠きながらもMF大島僚太が約2カ月ぶりに先発復帰した川崎が、リーグ優勝の立役者・FW金崎夢生を体調不良で欠く鹿島を運動量で上回り、押し込む展開を見せる^[28]。前半19分にはファウルを受けたMF小笠原満男がボールを蹴り返した川崎MF中村憲剛に対して激昂し、両者一触即発の状態となる^{[注 3]}が、これで引き締まった鹿島が反撃の機会をうかがう。すると前半42分、右サイドからのコーナーキックを得ると、MF遠藤康の放ったボールにゴール正面でDF山本脩斗が頭で合わせる。川崎GKチョン・ソンリョンが横っ飛びでこれをはじくも、ボールは左ポストに跳ね返ってゴールに吸い込まれ、鹿島が1点先制して前半を折り返す^[30]。

ハーフタイム、鹿島は先制点を挙げたDF山本を下げてDFファン・ソッコを投入、一方の川崎もMF登里享平を下げてMF三好康児を投入するが、この両者の交代策が試合を動かす^[30]。後半9分、川崎は右サイドで三好がスルーパスを送ると、これに反応したFW小林悠がファン・ソッコのチェックを交わしながら右足でシュート。これがゴール左隅に決まって川崎が同点に追いつく^[28]。これで流れを取り戻した川崎が攻勢に出るが、鹿島の集中した守備の前にあと一歩のところで決めきれない場面が繰り返される。鹿島は67分にFW鈴木優磨、88分には小笠原を下げてMFファブリシオを投入するも、決着はつかず、試合は15分ハーフの延長戦に突入する^[28]。

延長開始直後の3分、川崎のクリアミスを拾った鹿島FWファブリシオがエリア内でシュートを放つも川崎DFエドゥアルドがゴール正面で必死のクリア。しかしこれで得たコーナーキックの流れから、FW鈴木が頭で落としたボールをDF西大伍が粘ってキープ、こぼれたところをFWファブリシオがゴール右にハーフボレーを決めて鹿島が勝ち越す^[28][30]。勝ち越しを許した川崎はMF森谷賢太郎、FW森本貴幸を投入して局面の打開を図るが、鹿島の守備ブロックの前にゴールをこじ開けることができず、そのまま試合終了。鹿島が6大会ぶり5度目の天皇杯優勝を飾るとともに、2016年シーズン二冠を達成、三大大会19個目のタイトル獲得となった^[28][30]。一方川崎は、リーグ2位が3回、リーグカップ（ナビスコ杯・ルヴァン杯）準優勝が2回となかなかタイトルに手が届かなかったが、今回もタイトルを逃し、2016年シーズン限りでの退任が発表されていた監督の風間八宏、さらには2016年シーズン限りでの退団を示唆していたFW大久保嘉人を優勝で送り出すことはできなかった^[31]。